Python 创建表示网络中连接的Numpy数组
假设我有一个描述节点之间网络链接的数组:Python 创建表示网络中连接的Numpy数组,python,arrays,numpy,Python,Arrays,Numpy,假设我有一个描述节点之间网络链接的数组: array([[ 1., 2.], [ 2., 3.], [ 3., 4.]]) 这将是一个线性4节点网络,具有从节点1到节点2的链路,依此类推 将此信息转换为以下格式的数组的最佳方式是什么 array([[ 0., 1., 0., 0.], [ 0., 0., 1., 0.], [ 0., 0., 0., 1.], [ 0., 0., 0., 0.]]
array([[ 1., 2.],
[ 2., 3.],
[ 3., 4.]])
这将是一个线性4节点网络,具有从节点1到节点2的链路,依此类推
将此信息转换为以下格式的数组的最佳方式是什么
array([[ 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 0.],
[ 0., 0., 0., 1.],
[ 0., 0., 0., 0.]])
然后,列号表示“到节点”,行表示“从节点”
另一个例子是:
array([[ 1., 2.],
[ 2., 3.],
[ 2., 4.]])
给予
array([[ 0., 1., 0., 0.],
[ 0., 0., 1., 1.],
[ 0., 0., 0., 0.],
[ 0., 0., 0., 0.]])
节点ID应该是整数。此外,numpy中的行和列从零开始编号,因此我们必须在每个维度中减去一:
import numpy as np
conns = np.array([[ 1, 2],
[ 2, 3],
[ 3, 4]])
net = np.zeros((conns.max(), conns.max()), dtype=int)
# two possibilities:
# if you need the number of connections:
for conn in conns:
net[conn[0]-1, conn[1]-1] += 1
# if you just need a 1 for existing connection(s):
net[conns[:,0]-1, conns[:,1]-1] = 1
节点ID应该是整数。此外,numpy中的行和列从零开始编号,因此我们必须在每个维度中减去一:
import numpy as np
conns = np.array([[ 1, 2],
[ 2, 3],
[ 3, 4]])
net = np.zeros((conns.max(), conns.max()), dtype=int)
# two possibilities:
# if you need the number of connections:
for conn in conns:
net[conn[0]-1, conn[1]-1] += 1
# if you just need a 1 for existing connection(s):
net[conns[:,0]-1, conns[:,1]-1] = 1
节点ID应该是整数。此外,numpy中的行和列从零开始编号,因此我们必须在每个维度中减去一:
import numpy as np
conns = np.array([[ 1, 2],
[ 2, 3],
[ 3, 4]])
net = np.zeros((conns.max(), conns.max()), dtype=int)
# two possibilities:
# if you need the number of connections:
for conn in conns:
net[conn[0]-1, conn[1]-1] += 1
# if you just need a 1 for existing connection(s):
net[conns[:,0]-1, conns[:,1]-1] = 1
节点ID应该是整数。此外,numpy中的行和列从零开始编号,因此我们必须在每个维度中减去一:
import numpy as np
conns = np.array([[ 1, 2],
[ 2, 3],
[ 3, 4]])
net = np.zeros((conns.max(), conns.max()), dtype=int)
# two possibilities:
# if you need the number of connections:
for conn in conns:
net[conn[0]-1, conn[1]-1] += 1
# if you just need a 1 for existing connection(s):
net[conns[:,0]-1, conns[:,1]-1] = 1
float
可能不是存储节点ID的最佳变量类型。@eumiro Fair point,可能应该使用integer或bool,但这是我想要的示例。基于0的节点ID会使它更简单,too@njzk2是的,虽然由于源数据的原因,我一直坚持使用基于1的变量-这可能会使-1
成为第一步,但是…float
可能不是存储节点ID的最佳变量类型。@eumiro Fair point,可能应该使用integer或bool,但这说明了我想要什么。基于0的节点ID会使它更简单一些, too@njzk2是的,虽然由于源数据的原因,我一直坚持使用基于1的变量-可能会使-1
成为第一步,但是…float
可能不是存储节点ID的最佳变量类型。@eumiro Fair point,可能应该使用integer或bool,但这只是我想要的一个例子。基于0的节点ID会使它变得更简单,too@njzk2是的,虽然由于源数据的原因,我一直使用基于1的变量-可能会使-1
成为第一步,但是…float
可能不是存储节点ID的最佳变量类型。@eumiro Fair point,可能应该使用integer或bool,但这是我想要的示例。基于0的节点ID会使它更简单,too@njzk2是的,尽管由于源数据的原因,我一直坚持使用基于1的方法,但是可以将-1
作为第一步,而不是循环,您不能执行net[conns[:,0]-1,conns[:,1]-1]=1
?代替循环,你不能做net[conns[:,0]-1,conns[:,1]-1]=1
?代替循环,你不能做net[conns[:,0]-1,conns[:,1]-1
?代替循环,你不能做net[conns[:,0]-1,conns[:,1]=1
?