在python中打开csv文件以自定义词典

我想知道如何加载此csv文件：

Epitope,ID,Frequency,Assay

AVNIVGYSNAQGVDY,123431,27.0,Tetramer

DIKYTWNVPKI,887473,50.0,3H

LRQMRTVTPIRMQGG,34234,11.9,Elispot

进入python字典，如下所示：

d = {'AVNIVGYSNAQGVDY': [ID[123431],Frequency[27.0],Assay['Tetramer']], 'DIKYTWNVPKI': [ID[887473],Frequency[50.0],Assay['3H']], 'LRQMRTVTPIRMQGG': [ID[34234],Frequency[11.9],Assay['Elispot']]}

['AVNIVGYSNAQGVDY', '123431', '27.0', 'Tetramer']

---

我正在使用列表，因为我的实际文件更大，我将向这些列表附加更多值

首先，你知道这个模块吗？如果没有，请阅读介绍和示例，了解如何获得可数行。把每一张打印出来，它们看起来像这样：

d = {'AVNIVGYSNAQGVDY': [ID[123431],Frequency[27.0],Assay['Tetramer']], 'DIKYTWNVPKI': [ID[887473],Frequency[50.0],Assay['3H']], 'LRQMRTVTPIRMQGG': [ID[34234],Frequency[11.9],Assay['Elispot']]}

['AVNIVGYSNAQGVDY', '123431', '27.0', 'Tetramer']

或者，如果您使用

读写器

：

{'Epitope': 'AVNIVGYSNAQGVDY', 'ID': '123431', 
 'Frequency': '27.0', 'Assay': 'Tetramer'}

但是你不想要一个列表，或者一个字典列表；您需要一个列表字典，其中每个键是一行中的

表位

，对应的值是其他三个值，对吗？所以…只需将每一行插入字典即可：

d = {}
with open(path, 'rb') as f:
    with csv.DictReader(f) as reader:
        for row in reader:
            d[row['Epitope']] = [row['ID'], row['Frequency'], row['Assay']]

（如果使用普通的

读卡器

而不是

读卡器

，这将更加紧凑，但我认为如果几个月后再回到代码上来，这种方式会更具可读性。）

您还希望转换这些值并将它们用作另一个查找的键，但这应该很简单。例如：

            row_id = ID[int(row['ID'])]
            row_frequency = Frequency[float(row['Frequency'])]
            row_assay = Assay[row['Assay']]
            d[row['Epitope']] = [row_id, row_frequency, row_assay]

通过将行转换作为函数编写，然后使用字典理解，您可以稍微清理一下：

with open(path, 'rb') as f:
    with csv.DictReader(f) as reader:
        d = {row['Epitope']: process_row(row) for row in reader}