Python 使用rpy2.rpy_classic将脚本从rpy转换为rpy2

谈到python，我有点新手，但我想将使用rpy的python脚本转换为使用rpy2的python脚本。我们确实在某处安装了rpy（用于Python2.6.x），但它与当前版本的R（3.2.0）的性能不太好。但是，我们确实为这些脚本中使用的python版本安装了rpy2（python 2.7[.5]）

据我所知，这些是需要更改的行（我已稍微简化了函数）：

从rpy导入r
r、 库（“”，悄悄地=真）
r（“”）\
func
rpy\u classic
在早期主要用于证明rpy2中的低级接口可用于实现任何高级接口，包括
rpy
中的接口。它不是一个终极兼容性工具

使用rpy2的高级界面
robjects
，您的rpy代码如下所示：

from rpy2.robjects.packages import importr
from rpy2.robjects import r

lib=importr('<libname>')
rfunc=r("""
  function(x,a={options.a},b={options.b})  {{
    ... 
    *R code here* 
    ...
    l<-list(o=o,md=a+b) 
    l
  }}""".format(options=options))

out = rfunc(<python expression>).rx2('o')

从rpy2.robjects.packages导入导入
从rpy2.robjects导入r
lib=importr（“”）
rfunc=r（“”）
函数（x，a={options.a}，b={options.b}）{{
... 
*R代码在这里*
...
当我传递numpy对象时，我需要添加
import rpy2.robjects.numpy2ri
rpy2.robjects.numpy2ri.activate（）
，但这确实有效
out = r.func(<python expression>)['o']

import rpy2.rpy_classic as rpy

rpy.set_default_mode(rpy.NO_CONVERSION)

rpy.r.library('<libname>', quietly=True)
rpy.r("""\
func <- function(x,a={options.a},b={options.b})  {{
... 
*R code here* 
...
l<-list(o=o,md=a+b) 
l
}}""".format(options=options))

<rpy2.rpy_classic.Robj object at 0x2b9e48481510>

from rpy2.robjects.packages import importr
from rpy2.robjects import r

lib=importr('<libname>')
rfunc=r("""
  function(x,a={options.a},b={options.b})  {{
    ... 
    *R code here* 
    ...
    l<-list(o=o,md=a+b) 
    l
  }}""".format(options=options))

out = rfunc(<python expression>).rx2('o')