Python 将单列文件存储到字典中

我有一个如下所示的文件：

    >Organism1
    ETTGDMND
    >Organism2
    PDELMESPEER
    >Organism3
    YERLLRRAQ
    >Organism1
    EDLTEVSGIGC

我想创建一个字典，其中大写字母（=氨基酸序列）是键，生物体名称是值。 到目前为止，我已经：

    dict1 = {}
    for line in file.readlines():
        line = line.rstrip() 
        if ">" not in line:        # '>' not in the line=amino acid seq 
            key = line             #assign the line into a variable 'key' 
            dict1[key] = []        #make this variable the keys of dict1
        else:                      #if '>'is in the line = organism
            value = line
            dict1[key] = value  
    print dict1  

它会引发未定义“键”的错误消息。但我认为这是通过说key=line

使用同一输入文件的相关问题。如果我只想调用该文件中的氨基酸序列（出于其他目的），我会：

但它只打印了一个序列而不是所有序列。 有人能帮我吗？

---

谢谢

由于值总是在键之前，一种简单的方法是“记住”另一个变量中的值，在获取键时可以使用该变量。因此，以下措施应该有效：

dict1 = {}
file = open("somedata.dat")
for line in file:  # note you can leave out readlines() here
    line = line.rstrip()
    if line[0] == ">":    # safer to check just first char
        value = line[1:]  # use [1:] to drop the ">" from the value
    else:
        dict1[line] = value
print dict1

如果在一个值之后有多行氨基酸键，则所有键将使用相同的值

关于第二个问题，问题是这一行：

my_sequences = [line]

始终替换

my_sequences

，而不考虑其先前的值，因此您将得到一个包含最后处理的序列的单项目列表。替换为：

my_sequences.append(line)

---

它会在列表的末尾添加一个项目，并且它会执行您想要的操作。

键还是值哪个在前？您的第一行是>m1。这意味着代码将跟随

else

分支，其中未定义

key

。啊，这很有意义！是的，很好，这给了我所需要的。谢谢另外一个问题是，除了创建字典，如果我只想调用该文件中的氨基酸序列（出于另一个目的），我还做了我的_序列=[]对于文件中的行：line=line.rstrip（）如果“>”不在行中：my_sequences=[line]#将这些dna序列添加到列表中“my_sequences”打印my#sequences#但这只会给我一个序列

my_sequences.append(line)