为什么python用汉字书写？
这是我关于堆栈溢出的第一个问题，如果我的问题格式不正确，我想首先道歉。我对编码不是特别有经验，但我正在努力解决工作中的一个具体问题 我正在尝试替换一个大的fasta文件的头（用于对齐DNA序列）。我有一个包含fasta对齐方式（alignment.txt）的txt文件，其内容如下：为什么python用汉字书写？,python,fasta,Python,Fasta,这是我关于堆栈溢出的第一个问题，如果我的问题格式不正确，我想首先道歉。我对编码不是特别有经验，但我正在努力解决工作中的一个具体问题 我正在尝试替换一个大的fasta文件的头（用于对齐DNA序列）。我有一个包含fasta对齐方式（alignment.txt）的txt文件，其内容如下： >418035201_b1_168_m12_gag__Assembly_8 ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGTGGGGGAAA...... >418035201_b1_168_m12
>418035201_b1_168_m12_gag__Assembly_8
ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGTGGGGGAAA......
>418035201_b1_168_m12_gag__Assembly_19
ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGTGGGGGAAA......
>418035201_pM_s38_B168_m12_gag_c08_M13F_X00_consensus
>418035201_pM_s38_B168_m12_gag_c19_M13F_X00_consensus
....
>418035201_b1_168_m12_gag__Assembly_8
ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGTGGGGGAAA......
>418035201_b1_168_m12_gag__Assembly_19
ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGTGGGGGAAA......
>418035201_pM_s38_B168_m12_gag_c08_M13F_X00_consensus
>418035201_pM_s38_B168_m12_gag_c19_M13F_X00_consensus
....
#!/usr/bin/env python
fasta= open('alignment.txt','r')
newnames= open('newheaders.txt','r')
newfasta= open('newfasta.txt', 'w')
for line in fasta:
if line.startswith('>'):
newname= newnames.readline()
newfasta.write(newname)
else:
newfasta.write(line)
print line
fasta.close()
newnames.close()
newfasta.close()
>418035201_pM_s38_B168_m12_gag_c08_M13F_X00_consensus
䄊䝔䝇䝔䝃䝁䝁䝃䍔䝁䅔呔䅁呇䝇䝇䅇䅁呁䅔䅇䝔䅃䝔䝇䅁䅁䅁呔....
>418035201_pM_s38_B168_m12_gag_c19_M13F_X00_consensus
䄊䝔䝇䝔䝃䝁䝁䝃䍔䝁䅔呔䅁呇䝇䝇䅇䅁呁䅔䅇䝔䅃䝔䝇䝁䅁䅁呔....
ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGTGGGGGAAAATTAGATGCGTGGGAGAA....
[编辑：现在已解决。请参见下面。谢谢大家！]Python似乎在open（）函数中支持一个“encoding”参数来覆盖默认的编码格式。如果您知道输入和输出文件的正确编码是什么，您应该能够通过添加以下内容来更正它（在您的情况下，将实际编码替换为正确的编码）：
PS：问题似乎是由于Python 3默认使用Unicode进行文本文件I/O，这与Python 2.x有所不同。Python似乎支持open（）函数中的“encoding”参数来覆盖默认编码格式。如果您知道输入和输出文件的正确编码是什么，您应该能够通过添加以下内容来更正它（在您的情况下，将实际编码替换为正确的编码）：
PS：问题似乎是由于Python3在默认情况下对文本文件I/O使用Unicode，这是对Python2.x的更改。谢谢大家的帮助。现在解决了（本质上我是个白痴） 我是如何修复的：
我不确定是否所有这些步骤或只是其中的一些步骤都是必要的，但它现在正在按计划工作。再次感谢你的帮助。现在就去投票吧！[编辑：显然我的支持票没有显示出来，因为我的声誉很低…：/][/p>谢谢大家的帮助。现在解决了（本质上我是个白痴） 我是如何修复的：
我不确定是否所有这些步骤或只是其中的一些步骤都是必要的，但它现在正在按计划工作。再次感谢你的帮助。现在就去投票吧！[编辑：显然我的支持票没有显示出来，因为我的声誉很低…：/][/p>我的猜测是，可能您将文件解释为UTF-16，这样两个字节对被解释为一个字符。代码在我的系统上工作，直接通过
python2 test.py运行，没有任何IDE或任何东西。你在什么操作系统上运行这个？tobias_k说的有道理，我个人不明白为什么会发生这种情况，除非您的系统运行默认的localeconf UTF-16（/etc/locale.conflocale genlocale-apython2 test.py运行，没有任何IDE或任何东西。你在什么操作系统上运行这个？tobias_k说的有道理，我个人不明白为什么会发生这种情况，除非您的系统运行默认的localeconf UTF-16（/etc/locale.conflocale genlocale-a