Python 无法在ubuntu 13.04上安装pyhdf

当我尝试安装pyhdf时，会发生以下错误：

sudo easy_install -f pyhdf-0.8.3.tar.gz pyhdf
Searching for pyhdf
Best match: pyhdf 0.8.3
Processing pyhdf-0.8.3.tar.gz
Writing /tmp/easy_install-Q0FIMR/pyhdf-0.8.3/setup.cfg
Running pyhdf-0.8.3/setup.py -q bdist_egg --dist-dir /tmp/easy_install-Q0FIMR/pyhdf-0.8.3/egg-dist-tmp-wXq_6K
pyhdf/hdfext_wrap.c: In function ‘SWIG_Python_AddErrorMsg’:
pyhdf/hdfext_wrap.c:859:5: warning: format not a string literal and no format arguments [-Wformat-security]
pyhdf/hdfext_wrap.c: At top level:
pyhdf/hdfext_wrap.c:3048:17: fatal error: hdf.h: No such file or directory
compilation terminated.
pyhdf/hdfext_wrap.c: In function ‘SWIG_Python_AddErrorMsg’:
pyhdf/hdfext_wrap.c:859:5: warning: format not a string literal and no format arguments [-Wformat-security]
pyhdf/hdfext_wrap.c: At top level:
pyhdf/hdfext_wrap.c:3048:17: fatal error: hdf.h: No such file or directory
compilation terminated.
error: Setup script exited with error: Command "x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c pyhdf/hdfext_wrap.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/pyhdf/hdfext_wrap.o" failed with exit status 1
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/distutils/misc_util.py:252: RuntimeWarning: Parent module 'numpy.distutils' not found while handling absolute import
  from numpy.distutils import log

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你知道怎么了吗？谢谢。

您可能需要安装

libhdf4 dev

软件包

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与其使用

sudo

在系统中安装软件包，不如花些时间阅读。

要解决这个问题，首先需要安装hdf开发软件包

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sudo apt get install libhdf4 dev

即使使用libhdf4 dev软件包，您也可能会遇到缺少hdf.h文件的问题（我确实遇到过）。似乎code setup.py（在安装档案中）没有正确处理指定HDF4库所在位置的环境变量

我按照的分步说明解决了问题，但您必须在命令行中添加hdf库，而不是将其导出：

INCLUDE_DIRS=/usr/include/hdf/  [note it may be different in your system ]

sudo python setup.py install -i $INCLUDE_DIRS

如果没有/want szlib，NOSZIP变量也会出现同样的问题，但我在第29行修改了setup.py：

szip_installed=False

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然后安装就可以了。

有时候，在Ubuntu上安装基于C的python库（比如numpy，可能还有这个）不是很简单。我已经用PIP把它们安装在了拱门上，没有任何痛苦。谢谢。出现新错误：从numpy.distutils导入日志。我不知道为什么。谢谢，我这样做了，但仍然有错误。新错误发生了：/usr/lib/python2.7/dist packages/numpy/distutils/misc_util.py:252:RuntimeWarning:Parent模块“numpy.distutils”在处理numpy.distutils导入日志的绝对导入时找不到，我不知道为什么。如果您不想使用virtualenv，并且正在安装到全局命名空间，你可以试着安装ubuntu软件包

python-h5py

@Alexander，这是hdf5的，不是hdf4的。答案很好。很遗憾，他们还没有修复setup.py。