如何通过BioPython自动将PMC全文保存到磁盘？

有没有办法下载并保存Entrez模块返回到本地磁盘的XML文件？我目前正在做的是：

fetch = Entrez.efetch(db='pmc',
                     resetmode='xml',
                     id=ids,
                     rettype='full')
article =  fetch.read()

然后通过Python的write函数将

article

作为

str

对象保存为xml文件

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BioPython是否提供了一种将文件自动下载到磁盘上的方法？

我认为BioPython没有提供这样做的方法，但不需要这样做，因为您无需先保存到字符串即可完成此操作：

fetch = Entrez.efetch(db='pmc',
                 resetmode='xml',
                 id=ids,
                 rettype='full')

with open('fileNameToSave.xml', 'w') as f:
    f.write(fetch.read())

Chris_Rands在评论中指出，另一种方法是通过URL直接获取文件：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=protein&id=15718680

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为什么不直接查询efetch？就像我想下载大量PMC论文一样，NCBI有一些关于处理批量API请求的规则，我没有时间实现这些规则。BioPython已经实现了它们，所以我想知道BioPython是否有下载功能。我认为“resetmode”应该是“retmode”。谢谢，这正是我所做的。在以后的分析中，我需要str对象，所以我先将它保存到字符串中。