Python 脚本以删除行尾具有相同字符串的行，并将其余行以另一种格式保存在另一个文件中

我的文件如下所示：

|#tail |head   |edge_weight|edge_type                                   |
|Q8TBF5|Q9UKB1 |3.11133e-01|MI:0004 (affinity chromatography technology)|
|Q8TBF4|QQ15696|2.01461e-01|MI:0401 (biochemical)                       |
|Q8TBF4|Q15696 |3.11133e-01|MI:0004 (affinity chromatography technology)|

|#Tail|head    |edge_weight|edge_type            |
|Q8TBF4|QQ15696|0.201461   |MI:0401 (biochemical)|

我想删除具有“MI:0004（亲和层析技术）”的行，并将另一行保存在另一个文件中。我还想将格式更改为类似以下内容：

|#tail |head   |edge_weight|edge_type                                   |
|Q8TBF5|Q9UKB1 |3.11133e-01|MI:0004 (affinity chromatography technology)|
|Q8TBF4|QQ15696|2.01461e-01|MI:0401 (biochemical)                       |
|Q8TBF4|Q15696 |3.11133e-01|MI:0004 (affinity chromatography technology)|

|#Tail|head    |edge_weight|edge_type            |
|Q8TBF4|QQ15696|0.201461   |MI:0401 (biochemical)|

请注意，将原始边的权重更改为浮动，但在运行脚本时出错

我的剧本：

from math import log
file_path_in_2 = 'D:/Courses/Bioinformatics Diploma/Programming to bioinformatics/Assignments/Assignment_03/PathLinker_PPI.txt'
file_in_2 = open(file_path_in_2, 'r')
file_path_out_2 = 'D:/Courses/Bioinformatics Diploma/Programming to bioinformatics/Assignments/Assignment_03/PathLinker_PPI_others.txt'
file_out_2 = open(file_path_out_2, 'w')

file_out_2.write('#tail|head\tedge_weight\tedge_type\n')
for line in file_in_2:
     if 'MI:0004 (affinity chromatography technology)' not in line:
         line_items = line.split('\t')
         edge_weight = float(line_items[2])
         edge_weight = 1 - (edge_weight)
         new_string = '%s|%s\t%f\t%s' %(line_items[0], line_items[1], edge_weight, line_items[3])
         file_out_2.write(new_string)
file_out_2.close()
file_in_2.close()

我得到这个错误：

Traceback (most recent call last):
  File "E:\CIT656\pythonProjects\CIT656_Spring21\Assignment_03.py", line 29, in <module>
    edge_weight = float(line_items[2])
ValueError: could not convert string to float: 'edge_weight'

Process finished with exit code 1

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“E:\CIT656\pythonProjects\CIT656\u Spring21\Assignment\u 03.py”，第29行，在
边缘重量=浮动（行项目[2]）
ValueError:无法将字符串转换为浮点值：“边\重量”
进程已完成，退出代码为1

我还没有测试过这一点，但尝试在

line\u items=line.split（'\t'）之后添加以下语句。

这将导致它跳过数据文件中的标题行

或者，您可以在打开文件后立即添加：

file_in_2.readline()

---

这将读入并忽略文件中的第一行。

尝试找出第29行上的语句可能试图将字符串

'edge\u weight'

转换为浮点的原因。它可能正在尝试解析标题文本吗？是的，使用“\t”可以考虑将问题标题更改为类似“解析文件中以制表符分隔的文本时出现ValueError”，因为这就是问题的具体原因。非常感谢您的帮助：）没问题。解决问题的信息在回溯消息中。始终仔细阅读回溯，并思考它发生的原因。通常这会导致理解问题以及如何解决问题。