如何导入python包？

我是Python新手，需要使用一个名为chromosomer的基于Python的工具，该工具导入一些Python包，包括bioformat。生物形态有许多模块，包括床层。运行chromosomer时，我得到一个错误：

smeeta:~$ python
Python 2.7.6 (default, Jun 22 2015, 17:58:13) 
[GCC 4.8.2] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import chromosomer
>>> from chromosomer.cli import bioformats
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/chromosomer/cli.py", line 8, in <module>
    import bioformats.bed
ImportError: No module named bed
>>> import bioformats
>>> import bioformats.bed
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: No module named bed
>>> 

smeeta:~$python
Python 2.7.6（默认值，2015年6月22日，17:58:13）
[GCC 4.8.2]关于linux2
有关详细信息，请键入“帮助”、“版权”、“信用证”或“许可证”。
>>>进口染色体
>>>从chromosomer.cli导入生物格式
回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“”，第1行，在
文件“/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/chromosomer/cli.py”，第8行，在
进口生物床
ImportError:没有名为bed的模块
>>>进口生物制剂
>>>进口生物床
回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“”，第1行，在
ImportError:没有名为bed的模块
>>> 

如何安装程序包chromosomer及其相关程序包？

使用

pip

例如

#>pip安装
#>pip安装染色体

官方

pip

文档

适用于Python 2.7.9+和3.4+ 它应该预装有

pip

Python 2≤ 2.7.8和Python 3≤ 3.3 请按照此处的说明操作：

有关此问题的更多讨论，请参见：

---

因此，在python中，大多数东西都是使用

pip

命令安装的，这是安装python软件包的推荐工具

你也试过：

pip install python-bioformats

---

对于默认软件包以外的任何软件包，您需要在导入/使用它们之前安装它们

安装Python包的最常见和最方便的方法是通过包管理实用程序

1.安装pip：

sudo apt-get install python-pip  # for Debian/Ubuntu
sudo yum -y install python-pip  # for CentOS/RHEL

sudo pip install chromosomer

注意：对于Python 2.7.9+和3.4+

pip

是预安装的

---

2.安装python软件包：

sudo apt-get install python-pip  # for Debian/Ubuntu
sudo yum -y install python-pip  # for CentOS/RHEL

sudo pip install chromosomer

它将安装

bioformats

，

future

，

pyfaidx

，

PyVCF

，

6个作为依赖项的包。
注意：如果已经是
root
用户或使用
vitualenv
，则无需使用
sudo

验证-可以使用
pip freeze
命令验证安装：

(venv_bioinformatics)[nahmed@localhost virtualenvs]$ pip freeze
bioformats==0.1.14
chromosomer==0.1.3
future==0.16.0
pyfaidx==0.4.8.1
PyVCF==0.6.8
six==1.10.0
wheel==0.24.0

测试-我安装了染色体并导入，工作正常：

(venv_bioinformatics)[nahmed@localhost virtualenvs]$ python 
Python 2.7.5 (default, Sep 15 2016, 22:37:39) 
[GCC 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-4)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from chromosomer.cli import chromosomer
>>> 

感谢您的编辑和下面的答案；但是我已经使用sudo-epip安装了chromosomer及其依赖项——index url=-r requirements.txt。完成此操作后，我必须将/usr/local/lib/python2.7/dist-packages//添加到我的bashrc中的PYTHONPATH中。我仍然收到上面提到的导入错误..“from chromosomer.cli import chromosomer”对我来说很好，请参阅我答案的最后一部分。我的建议是，从bashrc中删除/卸载chromosomer包和路径行，然后重新安装；但这并不能解决我的问题。您是否尝试在Python shell中导入？另外，如果我只导入包，它会被导入，但是如果我尝试访问一个模块，它会抛出错误。请共享整个会话，即回溯（错误）和导致问题的导入语句。将其添加到问题中，作为编辑1：（在当前内容下方）是的，在Python shell中，程序包被顺利导入，但不是它们的模块<代码>导入

不会给出任何错误，而来自导入模块的

会抛出错误。。是的，除了six==1.5.2和Python是2.7.6之外，大多数安装包的版本都是相同的。。