通过计算集群加载python模块

我有一个使用科学Linux的计算集群的帐户。当然，我只有用户访问权限。我正在使用python，我需要运行python脚本，所以我需要导入一些python模块。由于我没有根访问权限，我在$HOME上安装了一个本地python副本，其中包含所有必需的模块。当我在我的帐户（托管节点）上运行脚本时，它们会正确运行。但是为了将作业提交到计算队列（在速度更快的机器上处理），我需要提交一个bash脚本，该脚本有一行代码来执行这些脚本。计算集群使用SunGrid引擎。然而，当我提交bash脚本时，我得到一个错误，我安装的模块找不到

因此，我对这个问题的理解是，模块没有被发送到执行脚本的机器上。我的问题是：是否可以在脚本中包含所有模块

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EDIT：我刚刚创建了一个运行

哪个python

的bash脚本，我注意到输出不是我的python副本。但是，当我在ssh帐户上运行“which python”时，我得到了正确的python副本。

提交的脚本很可能使用系统python安装，而不是您自己的。尝试仅使用一个命令提交shell脚本，

whichpython

，以进行确认

修复方法是将Python解释器的路径前置到系统路径。在我的机器上，正确的Python安装在

/Users/mbatchkarov/anaconda/bin/Python

。我添加了

export PATH=“/Users/mbatchkarov/anaconda/bin:$PATH”

到

~/.bash\u profile

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编辑将同一行添加到

~/.bashrc

请查看我的编辑。在我的ssh帐户上，所有设置都是正确的，但是当我发送作业运行时，它使用了一些其他python。请参阅我的编辑。如果它在ssh到计算节点时起作用，那么SGE必须生成非登录shell。您可以在这里了解登录shell和非登录shell之间的区别