在已编译的Cython代码上使用line profiler（在ipython中）

我读了这个问题的答案，但我似乎无法让它与我的设置一起工作

我有一个

cumsum.pyx

文件：

# cython: profile=True
# cython: linetrace=True
# cython: binding=True
DEF CYTHON_TRACE = 1

def cumulative_sum(int n):
    cdef int s=0, i
    for i in range(n):
        s += i

    return s

我是用以下方法编写的：

cython cumsum.pyx
gcc cumsum.c $(pkg-config --cflags --libs python3) -o cumsum.so -shared -fPIC

然后我尝试在

ipython

中对其进行分析：

%load_ext line_profiler
from cumsum import cumulative_sum
%lprun -f cumulative_sum cumulative_sum(100)

%load_ext cython
%%cython

# cython: profile=True
# cython: linetrace=True
# cython: binding=True
# distutils: define_macros=CYTHON_TRACE_NOGIL=1

def cumulative_sum(int n):
    cdef int s=0, i
    for i in range(n):
        s += i
    return s

我没有收到错误消息，只有一个空的配置文件：

Timer unit: 1e-06 s

Total time: 0 s
File: cumsum.pyx
Function: cumulative_sum at line 6

Line #      Hits         Time  Per Hit   % Time  Line Contents
==============================================================
     6                                           def cumulative_sum(int n):
     7                                               cdef int s=0, i
     8                                               for i in range(n):
     9                                                   s += i
    10                                           
    11                                               return s

我怎样才能让它工作

PS：我使用CMake，而不是

setup.py

，因此我希望有一个构建系统无关的解决方案

该解决方案已经包含了一个如何设置

CYTHON\u跟踪

宏的示例：

# distutils: define_macros=CYTHON_TRACE_NOGIL=1

而不是您的

DEF CYTHON\u TRACE=1

当我使用

%%cython

编译它时，它工作了：

%load_ext line_profiler
from cumsum import cumulative_sum
%lprun -f cumulative_sum cumulative_sum(100)

%load_ext cython
%%cython

# cython: profile=True
# cython: linetrace=True
# cython: binding=True
# distutils: define_macros=CYTHON_TRACE_NOGIL=1

def cumulative_sum(int n):
    cdef int s=0, i
    for i in range(n):
        s += i
    return s

并显示了配置文件：

%load_ext line_profiler
%lprun -f cumulative_sum cumulative_sum(100)
[...]
Line #      Hits         Time  Per Hit   % Time  Line Contents
==============================================================
     7                                           def cumulative_sum(int n):
     8         1            8      8.0      3.5      cdef int s=0, i
     9         1            3      3.0      1.3      for i in range(n):
    10       100          218      2.2     94.4          s += i
    11         1            2      2.0      0.9      return s

---

问题是

DEF CYTHON_TRACE=1

实际上没有设置正确的常数

解决办法包括：

一,。 ，使用distutils

二,。 将gcc行更改为

gcc cumsum.c $(pkg-config --cflags --libs python3) -o cumsum.so -shared -fPIC -DCYTHON_TRACE=1

三,。 制作一个额外的头

trace.h

并在那里设置常量

 #define CYTHON_TRACE 1

将以下内容添加到

cumsum.pyx

cdef extern from "trace.h":
    pass

四,。 使用CMake，添加

add_definitions(-DCYTHON_TRACE)

---

谢谢我试过了，但是没有解决问题。你能说得更具体一点吗。发生了什么？您是否使用了

cythonize（）

。如果你“预编译”它，它对你有用吗？啊，也许distutils行没有任何作用，因为我没有使用distutils@user357269是的，

#distutils:

-行仅在使用

cythonize

时有效（根据文档）。