Python Skimage.draw.ellipse生成两条不需要的线

我有一个布尔图像，其中零是背景，我想画一个椭圆，它包围从

skimage.measure.regionprops

检索到的对象的长轴和短轴。模块

skimage.draw.ellipse\u Permission

生成预期的椭圆，但也生成两条不需要的线

代码（输入图像为）：

但是，如果我创建一个如下的简化示例，我将获得预期的椭圆。有人能帮我理解我做错了什么吗

import numpy as np

img = np.zeros((1000,1000))
img[200:800,200:400] = 1

region = label(img)

props = regionprops(region)

props = props[0]

y0,x0 = props.centroid

rr,cc = skimage.draw.ellipse_perimeter(int(x0),int(y0),int(props.minor_axis_length*0.5),int(props.major_axis_length*0.5), orientation = props.orientation)

plt.plot(rr,cc, color = 'yellow')
plt.imshow(img, cmap = 'gray')
plt.show()

---

事实证明，

draw

模块返回的坐标被设计为索引到数组中，如图所示，而不是绘图：

rr，cc=ellipse\u周长（120400,60,20，方向=math.pi/4）
img[rr，cc，：]=（1,0,1）

要使用

plt.plot

并进行线图绘制，需要在坐标围绕圆/椭圆旋转时对其进行排序。默认情况下，它们没有正确排序，因为椭圆实际上是在四个单独的象限中绘制的，您可以通过以下方式找到它们。（提示：这些线正好击中椭圆垂直或水平的位置。）

由于您有一个凸面，计算每个点与椭圆中心之间的角度就足以对点进行排序。请尝试以下操作：

fig, ax = plt.subplots()
_ = ax.imshow(TP_mask, cmap='gray')

angle = np.arctan2(rr - np.mean(rr), cc - np.mean(cc))
sorted_by_angle = np.argsort(angle)
rrs = rr[sorted_by_angle]
ccs = cc[sorted_by_angle]

_ = ax.plot(rrs, ccs, color='red')

其中：

---

事实证明，

draw

模块返回的坐标被设计为索引到数组中，如图所示，而不是绘图：

rr，cc=ellipse\u周长（120400,60,20，方向=math.pi/4）
img[rr，cc，：]=（1,0,1）

要使用

plt.plot

并进行线图绘制，需要在坐标围绕圆/椭圆旋转时对其进行排序。默认情况下，它们没有正确排序，因为椭圆实际上是在四个单独的象限中绘制的，您可以通过以下方式找到它们。（提示：这些线正好击中椭圆垂直或水平的位置。）

由于您有一个凸面，计算每个点与椭圆中心之间的角度就足以对点进行排序。请尝试以下操作：

fig, ax = plt.subplots()
_ = ax.imshow(TP_mask, cmap='gray')

angle = np.arctan2(rr - np.mean(rr), cc - np.mean(cc))
sorted_by_angle = np.argsort(angle)
rrs = rr[sorted_by_angle]
ccs = cc[sorted_by_angle]

_ = ax.plot(rrs, ccs, color='red')

其中：

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您能与我们共享您的输入图像吗？这样我们就可以运行代码并帮助诊断问题了？嗨@Juan，我刚刚添加了一个与输入图像的链接。谢谢谢谢这帮我为你找到了答案！=）你能和我们分享你的输入图像吗，这样我们就可以运行代码并帮助诊断问题了？嗨@Juan，我刚刚添加了一个与输入图像的链接。谢谢谢谢这帮我为你找到了答案！=）非常感谢您对@Juan的详细而直接的解释。非常感谢您对@Juan的详细而直接的解释。