Python 使用SQLalchemy的动态表名
我正在尝试将旧的sqlite3代码转换为sql炼金术。我试图弄清楚如何最好地处理我的用例。我不熟悉数据库访问的ORM方法 我正在尝试根据公共定义动态生成唯一的表名。我已经阅读了这篇文章以及关于如何使用Python 使用SQLalchemy的动态表名,python,sqlalchemy,Python,Sqlalchemy,我正在尝试将旧的sqlite3代码转换为sql炼金术。我试图弄清楚如何最好地处理我的用例。我不熟悉数据库访问的ORM方法 我正在尝试根据公共定义动态生成唯一的表名。我已经阅读了这篇文章以及关于如何使用类型的文章,但我仍然不确定我会如何去做。以下是我到目前为止的情况: from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base from sqlalchemy import Table, Column, Integer, String, MetaD
类型的文章,但我仍然不确定我会如何去做。以下是我到目前为止的情况:
from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base
from sqlalchemy import Table, Column, Integer, String, MetaData, ForeignKey
from sqlalchemy.ext.declarative import declared_attr
Base = declarative_base()
class DynamicName(object):
@declared_attr
def __tablename__(cls):
return cls.__name__.lower()
class Genome(DynamicName, Base):
__tablename__ = 'AbstractGenome'
AlignmentId = Column(Integer, primary_key=True)
StartOutOfFrame = Column(Integer)
BadFrame = Column(Integer)
def build_genome_table(genome):
d = {'__tablename__': genome}
table = type(genome, (Genome,), d)
return table
如果我尝试使用此选项,它将不起作用:
>>> from sqlalchemy import create_engine
>>> engine = create_engine('sqlite:///:memory:', echo=True)
>>> genomes = ["A", "B"]
>>> tables = {x: build_genome_table(x) for x in genomes}
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "<stdin>", line 1, in <dictcomp>
File "<stdin>", line 3, in build_genome_table
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/api.py", line 55, in __init__
_as_declarative(cls, classname, cls.__dict__)
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 88, in _as_declarative
_MapperConfig.setup_mapping(cls, classname, dict_)
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 103, in setup_mapping
cfg_cls(cls_, classname, dict_)
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 135, in __init__
self._early_mapping()
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 138, in _early_mapping
self.map()
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 529, in map
**self.mapper_args
File "<string>", line 2, in mapper
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/orm/mapper.py", line 623, in __init__
self._configure_inheritance()
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/orm/mapper.py", line 930, in _configure_inheritance
self.local_table)
File "<string>", line 2, in join_condition
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/sql/selectable.py", line 839, in _join_condition
(a.description, b.description, hint))
sqlalchemy.exc.NoForeignKeysError: Can't find any foreign key relationships between 'AbstractGenome' and 'A'.
来自sqlalchemy导入创建引擎的>>
>>>engine=create_engine('sqlite://:memory:',echo=True)
>>>基因组=[“A”,“B”]
>>>tables={x:build_genome_table(x)for x in genomes}
回溯(最近一次呼叫最后一次):
文件“”,第1行,在
文件“”,第1行,在
文件“”,第3行,内建表
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/api.py”,第55行,在__
_as_声明性(cls,classname,cls.\uu dict\uuuuu)
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第88行,在声明性
_设置映射(cls、类名、dict)
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第103行,在设置映射中
cfg_cls(cls_,类名,dict_)
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第135行,在__
self._early_mapping()
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第138行,在早期映射中
self.map()
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,地图中第529行
**self.mapper_args
文件“”,第2行,在映射器中
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/orm/mapper.py”,第623行,在__
self.\u配置\u继承()
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/orm/mapper.py”,第930行,在_configure_继承中
self.local_表)
文件“”,第2行,处于连接状态
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/sql/selectable.py”,第839行,处于“连接”状态
(a.描述,b.描述,提示)
sqlalchemy.exc.NoForeignKeyError:找不到'AbstractGenome'和'A'之间的任何外键关系。
如何根据传递的名称动态生成基因组
表?理想情况下,我还希望有一个可以进行分层继承的设置,这样我就可以声明不同的子类,如ReferenceGenome
或TargetGenome
,它们有额外的列,但也可以有动态名称。请参见:sqlalchemy.orm.mapper
:。我的理解(因为我过去只使用这个函数修改过代码)是,它直接将模型类映射到表对象,而表对象本身连接到数据库表
这个用例听起来与配方历史非常相似。进行排序可能需要一些时间,但此处将基于现有模型(版本控制的任何子类)动态创建一个表对象,然后在创建类时直接映射到数据库表
但问题是:您确实需要映射到一个实际的数据库表。毕竟这是一个ORM。您在这里有几个选项:
如果要动态创建将在数据库中持久化的表,可以使用table.create(),如下所示:
如果您只需要偶尔创建表,则可以与alembic集成:
如果您只需要为一个进程使用它,而不再需要它,那么您可以创建临时表,尽管我不确定SQLAlchemy是否直接支持它。我检查的少数资源似乎正在使用create()和drop()。我还没有使用SQLAlchemy 1.0+,所以它可能有一些我从未见过的支持
如果这里有什么不清楚的地方,请告诉我。我已经有一段时间没有玩history\u meta.py了,所以我可能已经生锈了。SQLAlchemy正在尝试设置继承,但失败了,因为a
表和AbstractGenome
表之间没有外键。您真的打算创建A
表和AbstractGenome
表吗?如果没有,你应该在你的类基因组定义中加入\uuuuu abstract\uuuu=True
。