Python 使用SQLalchemy的动态表名

Python 使用SQLalchemy的动态表名,python,sqlalchemy,Python,Sqlalchemy,我正在尝试将旧的sqlite3代码转换为sql炼金术。我试图弄清楚如何最好地处理我的用例。我不熟悉数据库访问的ORM方法 我正在尝试根据公共定义动态生成唯一的表名。我已经阅读了这篇文章以及关于如何使用类型的文章,但我仍然不确定我会如何去做。以下是我到目前为止的情况: from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base from sqlalchemy import Table, Column, Integer, String, MetaD

我正在尝试将旧的sqlite3代码转换为sql炼金术。我试图弄清楚如何最好地处理我的用例。我不熟悉数据库访问的ORM方法

我正在尝试根据公共定义动态生成唯一的表名。我已经阅读了这篇文章以及关于如何使用
类型的文章,但我仍然不确定我会如何去做。以下是我到目前为止的情况:

from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base
from sqlalchemy import Table, Column, Integer, String, MetaData, ForeignKey
from sqlalchemy.ext.declarative import declared_attr

Base = declarative_base()


class DynamicName(object):
    @declared_attr
    def __tablename__(cls):
        return cls.__name__.lower()

class Genome(DynamicName, Base):
    __tablename__ = 'AbstractGenome'
    AlignmentId = Column(Integer, primary_key=True)
    StartOutOfFrame = Column(Integer)
    BadFrame = Column(Integer)

def build_genome_table(genome):
    d = {'__tablename__': genome}
    table = type(genome, (Genome,), d)
    return table
如果我尝试使用此选项,它将不起作用:

>>> from sqlalchemy import create_engine
>>> engine = create_engine('sqlite:///:memory:', echo=True)
>>> genomes = ["A", "B"]
>>> tables = {x: build_genome_table(x) for x in genomes}
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "<stdin>", line 1, in <dictcomp>
  File "<stdin>", line 3, in build_genome_table
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/api.py", line 55, in __init__
    _as_declarative(cls, classname, cls.__dict__)
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 88, in _as_declarative
    _MapperConfig.setup_mapping(cls, classname, dict_)
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 103, in setup_mapping
    cfg_cls(cls_, classname, dict_)
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 135, in __init__
    self._early_mapping()
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 138, in _early_mapping
    self.map()
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 529, in map
    **self.mapper_args
  File "<string>", line 2, in mapper
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/orm/mapper.py", line 623, in __init__
    self._configure_inheritance()
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/orm/mapper.py", line 930, in _configure_inheritance
    self.local_table)
  File "<string>", line 2, in join_condition
  File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/sql/selectable.py", line 839, in _join_condition
    (a.description, b.description, hint))
sqlalchemy.exc.NoForeignKeysError: Can't find any foreign key relationships between 'AbstractGenome' and 'A'.
来自sqlalchemy导入创建引擎的
>>
>>>engine=create_engine('sqlite://:memory:',echo=True)
>>>基因组=[“A”,“B”]
>>>tables={x:build_genome_table(x)for x in genomes}
回溯(最近一次呼叫最后一次):
文件“”,第1行,在
文件“”,第1行,在
文件“”,第3行,内建表
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/api.py”,第55行,在__
_as_声明性(cls,classname,cls.\uu dict\uuuuu)
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第88行,在声明性
_设置映射(cls、类名、dict)
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第103行,在设置映射中
cfg_cls(cls_,类名,dict_)
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第135行,在__
self._early_mapping()
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,第138行,在早期映射中
self.map()
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py”,地图中第529行
**self.mapper_args
文件“”,第2行,在映射器中
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/orm/mapper.py”,第623行,在__
self.\u配置\u继承()
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/orm/mapper.py”,第930行,在_configure_继承中
self.local_表)
文件“”,第2行,处于连接状态
文件“/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site packages/sqlalchemy/sql/selectable.py”,第839行,处于“连接”状态
(a.描述,b.描述,提示)
sqlalchemy.exc.NoForeignKeyError:找不到'AbstractGenome'和'A'之间的任何外键关系。

如何根据传递的名称动态生成
基因组
表?理想情况下,我还希望有一个可以进行分层继承的设置,这样我就可以声明不同的子类,如
ReferenceGenome
TargetGenome
,它们有额外的列,但也可以有动态名称。

请参见:
sqlalchemy.orm.mapper
:。我的理解(因为我过去只使用这个函数修改过代码)是,它直接将模型类映射到表对象,而表对象本身连接到数据库表

这个用例听起来与配方历史非常相似。进行排序可能需要一些时间,但此处将基于现有模型(版本控制的任何子类)动态创建一个表对象,然后在创建类时直接映射到数据库表

但问题是:您确实需要映射到一个实际的数据库表。毕竟这是一个ORM。您在这里有几个选项:

  • 如果要动态创建将在数据库中持久化的表,可以使用table.create(),如下所示:

  • 如果您只需要偶尔创建表,则可以与alembic集成:

  • 如果您只需要为一个进程使用它,而不再需要它,那么您可以创建临时表,尽管我不确定SQLAlchemy是否直接支持它。我检查的少数资源似乎正在使用create()和drop()。我还没有使用SQLAlchemy 1.0+,所以它可能有一些我从未见过的支持


  • 如果这里有什么不清楚的地方,请告诉我。我已经有一段时间没有玩history\u meta.py了,所以我可能已经生锈了。

    SQLAlchemy正在尝试设置继承,但失败了,因为
    a
    表和
    AbstractGenome
    表之间没有外键。您真的打算创建
    A
    表和
    AbstractGenome
    表吗?如果没有,你应该在你的
    类基因组定义中加入
    \uuuuu abstract\uuuu=True