无法运行.py文件,但python中的所有代码都可用 来自Bio导入序列 导入re、os 作为pd进口熊猫 从生物序列导入序列 从Bio.Alphabet导入通用\u dna 从Bio.SeqRecord导入SeqRecord chdir('c:\\Users\Workspace\\Desktop') f_out=os.path.join(os.getcwd(),'convertedgisaid','pandemic2009.txt') fileNameStruct=“pandemic2009p” fileCount=0 fout=打开(f_out,'w') _文件的数量=5 而(fileCount
尝试重新格式化代码,例如使用无法运行.py文件,但python中的所有代码都可用 来自Bio导入序列 导入re、os 作为pd进口熊猫 从生物序列导入序列 从Bio.Alphabet导入通用\u dna 从Bio.SeqRecord导入SeqRecord chdir('c:\\Users\Workspace\\Desktop') f_out=os.path.join(os.getcwd(),'convertedgisaid','pandemic2009.txt') fileNameStruct=“pandemic2009p” fileCount=0 fout=打开(f_out,'w') _文件的数量=5 而(fileCount,python,biopython,Python,Biopython,尝试重新格式化代码,例如使用 您可以在此处阅读有关如何设置代码格式的更多信息:错误是什么?通过在此处添加错误更新您的问题什么是“无法运行”意思是?尝试时会发生什么?当我使用tab时,它无法读取缩进。表示存在:缩进错误:应为缩进块,但当我运行.py文件时,它只是关闭,没有任何解释:/ from Bio import SeqIO import re, os import pandas as pd from Bio.Seq import Seq from Bio.Alphabet import gen
您可以在此处阅读有关如何设置代码格式的更多信息:错误是什么?通过在此处添加错误更新您的问题什么是“无法运行”意思是?尝试时会发生什么?当我使用tab时,它无法读取缩进。表示存在:缩进错误:应为缩进块,但当我运行.py文件时,它只是关闭,没有任何解释:/
from Bio import SeqIO
import re, os
import pandas as pd
from Bio.Seq import Seq
from Bio.Alphabet import generic_dna
from Bio.SeqRecord import SeqRecord
os.chdir('c:\\Users\Workspace\\Desktop')
f_out = os.path.join(os.getcwd(),'convertedgisaid','pandemic2009.txt')
fileNameStruct = "pandemic2009p"
fileCount = 0
fout = open(f_out,'w')
number_of_files = 5
while(fileCount<number_of_files):
f_in = os.path.join(os.getcwd(),'convertedgisaid',fileNameStruct+str(fileCount)+".txt")
f = open(f_in,'r')
records = f.read()
records = re.sub("_"," ",records)
records = records.split('\n')
records = records[1:]
for rec in records:
current = rec.split('|')
fout.write(current[0]+" "+rec[-1:]+"\n")
fileCount+=1
fout.close()