python中3D数组值的Matplotlib动画
我目前想将Walabot设备中的3D rawdata可视化,并将其显示在使用matplotlib FuncAnimation创建的3D动画中。我已经在寻找答案,但我找不到任何有用的东西。 在我的例子中,我已经有了一个三维数组,其中每个索引都有一个特定的值,该值随时间而变化。我已经能想出如何用不同的颜色和大小在3D图表中显示它,但现在我想自己进行更新。我发现了一些示例代码,这给了我一个良好的开端,但我的图表本身并没有更新。我必须关闭窗口,然后窗口再次弹出,与3D数组中的值不同。你们知道怎么解决这个问题吗? 以下是我目前的代码:python中3D数组值的Matplotlib动画,python,arrays,matplotlib,3d,refresh,Python,Arrays,Matplotlib,3d,Refresh,我目前想将Walabot设备中的3D rawdata可视化,并将其显示在使用matplotlib FuncAnimation创建的3D动画中。我已经在寻找答案,但我找不到任何有用的东西。 在我的例子中,我已经有了一个三维数组,其中每个索引都有一个特定的值,该值随时间而变化。我已经能想出如何用不同的颜色和大小在3D图表中显示它,但现在我想自己进行更新。我发现了一些示例代码,这给了我一个良好的开端,但我的图表本身并没有更新。我必须关闭窗口,然后窗口再次弹出,与3D数组中的值不同。你们知道怎么解决这个
def update(plot, signal, figure):
plot.clear()
scatterplot = plot.scatter(x, y, z, zdir='z', s=signal[0], c=signal[0])
figure.show()
return figure
def calc_RasterImage(signal):
# 3D index is represnted is the following schema {i,j,k}
# sizeX - signal[1] represents the i dimension length
# sizeY - signal[2] represents the j dimension length
# sizeZ - signal[3] represents the k dimension length
# signal[0][i][j][k] - represents the walabot 3D scanned image (internal data)
#Initialize 3Dplot with matplotlib
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
ax.set_xlim([xMin-1,xMax-1])
ax.set_ylim([yMin-1,yMax-1])
ax.set_zlim([zMin-1,zMax-1])
ax.set_xlabel('X AXIS')
ax.set_ylabel('Y AXIS')
ax.set_zlabel('Z AXIS')
scatterplot = ax.scatter(x, y, z, zdir='z', s=signal[0], c= signal[0])
cbar = plt.colorbar(scatterplot)
cbar.set_label('Density')
#def update(signal):
# ax.clear()
# scatterplot = ax.scatter(x, y, z, zdir='z', s=signal[0], c=signal[0])
ani = anim.FuncAnimation(fig, update(ax, signal, plt), frames=10 , blit=True, repeat = True)
def main():
wlbt = Walabot()
wlbt.connect()
if not wlbt.isConnected:
print("Not Connected")
else:
print("Connected")
wlbt.start()
calc_index(wlbt.get_RawImage_values())
while True:
#print_RawImage_values(wlbt.get_RawImage_values())
calc_RasterImage(wlbt.get_RawImage_values())
wlbt.stop()
if __name__ == '__main__':
main()
正如你所看到的那样
ani = anim.FuncAnimation(fig, update(ax, signal, plt), frames=10 , blit=True, repeat = True)
需要顶部的更新功能。此函数用于清除我的绘图,并使用不同的值重新创建新的绘图。但我总是需要先关闭绘图窗口,我希望避免这种情况。
这是情节的样子:
你们有办法解决这个问题吗
干杯您的代码并不是一个真正的最小工作示例,您不应该懒惰,在开始之前实际阅读有关FuncAnimation的文档。也就是说,类似这样的方法应该有效:
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Display walabot output.
"""
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation
def display(walabot_instance):
# set x, y, z
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
path_collection = ax.scatter(x, y, z, zdir='z')
# do your labelling, layout etc
def update(ignored, walabot_instance):
signal = walabot_instance.get_RawImage_values()
path_collection.set_sizes(signal[0])
path_collection.set_color(signal[1])
return path_collection,
return FuncAnimation(fig, update, fargs=[walabot_instance])
def main():
wlbt = Walabot()
wlbt.connect()
if not wlbt.isConnected:
print("Not Connected")
else:
print("Connected")
wlbt.start()
plt.ion()
animation = display(wlbt)
raw_input("Press any key when done watching Walabot...")
if __name__ == "__main__":
main()
如果您有任何问题(在阅读文档之后!),请发表评论 谢谢你的帮助!在试用了你的代码并将其调整到我的代码之后,它终于成功了。我在看文档(),但我不知道如何正确使用它,因为我不太擅长编码。无论如何,这是我的新代码:
def calc_index(signal):
for i in range(0, signal[1], 1):
for j in range(0, signal[2], 1):
for k in range(0, signal[3], 1):
#Location of Index
x.append(i)
y.append(j)
z.append(k)
def display(walabot_instance):
# 3D index is represnted is the following schema {i,j,k}
# sizeX - signal[1] represents the i dimension length
# sizeY - signal[2] represents the j dimension length
# sizeZ - signal[3] represents the k dimension length
# signal[0][i][j][k] - represents the walabot 3D scanned image (internal data)
#Initialize 3Dplot with matplotlib
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
signal = walabot_instance.get_RawImage_values()
path_collection = ax.scatter(x, y, z, zdir='z', s=signal[0], c=signal[0])
#Plot labeling
ax.set_xlim([xMin-1,xMax-1])
ax.set_ylim([yMin-1,yMax-1])
ax.set_zlim([zMin-1,zMax-1])
ax.set_xlabel('X AXIS')
ax.set_ylabel('Y AXIS')
ax.set_zlabel('Z AXIS')
cbar = plt.colorbar(path_collection)
cbar.set_label('Density')
def update(ignored, walabot_instance):
ax.clear()
signal_update = walabot_instance.get_RawImage_values()
path_collection = ax.scatter(x, y, z, zdir='z', s=signal_update[0], c=signal_update[0])
return path_collection
return FuncAnimation(fig, update, fargs=[walabot_instance])
def main():
wlbt = Walabot()
wlbt.connect()
if not wlbt.isConnected:
print("Not Connected")
else:
print("Connected")
wlbt.start()
calc_index(wlbt.get_RawImage_values())
plt.ion()
animation = display(wlbt)
raw_input("Press any key when done watching Walabot...")
wlbt.stop()
if __name__ == '__main__':
main()
我仍然不明白的是你在用什么
fargs=[walabot_instance]
在的动画函数中?我只是没有得到这方面的文件。。
这意味着什么
def func(fr: object, *fargs) -> iterable_of_artists:
及
在func和frames参数的FuncAnimation文档中?只是为了更好地理解这个过程
为什么更新需要被忽略的参数输入?它不在任何地方使用
非常感谢 批评缺失的mcve并仍然提供答案似乎有点矛盾,而答案本身并没有任何解释。我想提醒发问者问题缺少清晰性应该是一个评论;另一方面,如果你能回答这个问题,为什么还要为mcve丢失而烦恼呢?或者反过来说:如果问题不清楚,为什么要提供答案?在任何情况下,输入一段代码,然后说“如果你想理解它,请阅读文档”同样糟糕。@ImportanceOfBeingErnest我让他先阅读文档,然后再问剩余的问题。我想说的是,我实际说的话和你描述它的方式是有区别的。
FuncAnimation
不是为你的用例设计的。预期的用例是,您正在描述一个动态系统的演化,这是确定性的,因为您已经拥有所有数据,或者您知道将系统状态描述为时间函数的函数<代码>更新因此需要一个浮点数或一个表示时间的整数,可用于计算系统的新状态或新状态本身(以生成器函数或数据本身的形式)。在您的情况下,系统的新状态在运行时确定。你也许可以把你的实例包装成一个看起来像发电机的东西(它不会),但对我来说这似乎太复杂了。因此,frame
参数是多余的,我忽略了它。fargs
用于向更新函数传递附加参数。查看代码,我刚刚意识到您可能甚至不需要传入它(最初,我没有将update
函数设计为闭包,在这种情况下,walabot实例不在范围内,因此您不需要传入它)。
def gen_function() -> obj: