Python 蛇人：Tranverse DAG深度优先？

Snakemake似乎以宽度优先的方式穿过DAG。是否可能（例如通过选项/标志等）强制snakemake首先穿过DAG深度？

我可以想到的一种方法是为每个规则设置优先级：

rule all:
    input:
        ["third_a.txt", "third_b.txt", "third_c.txt"]

rule first:
    output:
        touch("first_{sample}.txt")
    priority: 1

rule second:
    input:
        rules.first.output
    output:
        touch("second_{sample}.txt")
    priority: 2

rule third:
    input:
        rules.second.output
    output:
        touch("third_{sample}.txt")
    priority: 3

---

如果您现在使用

snakemake-j1

运行它，它将首先执行深度

当依赖项尚未生成时，如何生成文件？总的来说，你想解决什么问题？@DmitryKuzminov说我有输入文件A、B和C。规则1生成相应的文件A\u preproc、B\u preproc和C\u preproc。规则2使用每个*_预处理文件生成一个_final、B_final和C_final。现在有两个选项可以遍历生成的DAG：（1）首先生成所有*_预处理文件，然后生成所有*_最终文件，或者（2）生成一个_预处理文件，然后生成一个_最终文件，然后生成B_预处理文件和B_最终文件，等等。我将第一个遍历顺序称为宽度优先，而第二个是深度优先。我希望这能把事情弄清楚：）