Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/7/sqlite/3.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Python 是否有一种方法可以同时从斯德哥尔摩文件中读取多条路线_Python_Bioinformatics_Biopython_Skbio - Fatal编程技术网

Python 是否有一种方法可以同时从斯德哥尔摩文件中读取多条路线

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我试图使用skbio读取一个斯德哥尔摩文件,该文件包含多个msa(多序列比对)

似乎它只能读取文件中的第一个对齐方式

import skbio.io
from skbio import RNA, TabularMSA

msa=TabularMSA.read(file,constructor= RNA)

我只得到一个tablermsa对象,而不是文件中的所有tablermsa对象

import skbio.io
from skbio import RNA, TabularMSA

msa=TabularMSA.read(file,constructor= RNA)

Biopython中有这样的功能,可以一次读取多条路线

from Bio import AlignIO
alignments=AlignIO.parse(file ,'stockholm')
在skbio中是否有类似的函数或代码可以做到这一点