如何让R从一个大目录下的多个子目录中读取文件？

我正试图开始写我的第一个R代码。我一直在寻找这个答案，但我不太确定我找到的正是我想要的。我知道如何让R读入同一子目录中的多个文件，但我不太确定如何让R读入多个子目录中的一个特定文件

例如，我有一个包含一系列轨迹复制的主目录，每个复制都在它自己的子目录中。细分如下：

“主目录”->“子目录”->“复制目录1-6”

从每个“ReplicateDir”中，我希望R从中提取要读取的“RMSD.dat”表（文件）。所有RMSD.dat文件都有相同的名称，它们只是在不同的目录中，当然包含不同的数据

我可以将所有文件移到一个文件夹中，但这似乎不是解决此问题的最有效方法

如果有人能启发我，我将不胜感激

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谢谢

这应该行得通，当然将

我的目录

更改到您的目录

dat.files  <- list.files(path="Main Dir",
                                recursive=T,
                                pattern="RMSD.dat"
                                ,full.names=T)

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dat.files
list.files（“Main Dir”，recursive=T）
？加上
pattern=“^RMSD\\.dat$”
这非常有效！非常感谢你。但是，由于这会生成一个很长的文件列表，您认为这会允许我“进入”列表中的每个文件，并从每个文件的子集1列中进行块平均吗？@D.a.Ragland我很高兴看到它对您有效。原则上是的，有不同的方法从列表中对元素进行子集设置（请看一看），或者您可能更喜欢在循环中跳过列表，并将子集分别应用于每个元素，或者将元素合并到一个数据帧中。这在很大程度上取决于数据的性质、您希望如何使用数据等。有大量的解决方案，可以解决许多与列表相关的问题，值得探索，而且您可以随时询问。
readDatFile <- function(f) {
  dat.fl <- read.csv(f) # You may have to change read.csv to match your data type
}

data.files <- sapply(dat.files, readDatFile)