R中的共色散

我尝试使用edge R软件包来分析我的数据，如下所示

Warning message:
In estimateGLMCommonDisp.default(y = y$counts, design = design,  :
  No residual df: setting dispersion to NA

这是我的数据帧，叫做子数据

                       A                        B                  C                    D              E
1               13707             13866          12193          12671       10178
2                   0                           0              0                       0               1
3                7165                5002           1256           1341        2087
6                8537              16679           9042           9620       19168
10              19438          25234          15563          16419       16582
16                  3                       3                   11                3                  5

genotype=factor(c("LMS1","LRS1","MS3","MS4","RS5"))
y=DGEList(counts=data.matrix(subdata),group=genotype)


design=model.matrix(~0+group,data=subdata)    
y=estimateGLMCommonDisp(y,design, verbose=TRUE)

我试图计算共同的离散度来估计上调和下调基因，但我得到如下错误信息

Warning message:
In estimateGLMCommonDisp.default(y = y$counts, design = design,  :
  No residual df: setting dispersion to NA

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请任何人帮我解决这个问题，我真的很感激

所以你对每个小组都有一个单独的观察结果？是的，我对每个小组都有一个单独的观察结果。请阅读张贴指南。特别是，请发布返回警告消息的确切命令。我还强烈建议您使用

dput

发布您的数据，使我们能够轻松重现您的问题。最后，警告不是错误消息。您的计算已成功完成，但如前所述，由于缺少残差，因此无法计算离散值。在示例中，计数和数据参数不一样，这是否有帮助<我非常感谢你的帮助