列出脚本中所需的所有包，假设R中的package:：function（）

假设脚本中的所有非基R函数都由

package:：function（）

调用。因此，在脚本运行期间，它没有任何完整的包负载。假设我们有一个名为

run.R

的R脚本，包含以下内容

"data.table::fread(file)"

在本例中，脚本需要

data.table

包。我正在寻找一个R函数，读取此外部

run.R

脚本将提供安装所有请求的软件包的代码，即：

install.packages("data.table") 

---

对现有的函数或策略有什么想法吗？

您可以使用regex尝试类似的方法：

f <- file("/path/to/here/file.R") # set up connection to file

file_lines <- readLines(con = f) # read file into list

close(f)

pckgs <- lapply(file_lines, function(l) { 
  if(grepl("::", l)){
    gsub(".*?([[:alnum:]\\.]+)::.*","\\1", l) 
  } else {
    return(NULL)
  }

})  
unique(unlist(pckgs))

---

f您可以使用regex尝试以下操作：

f <- file("/path/to/here/file.R") # set up connection to file

file_lines <- readLines(con = f) # read file into list

close(f)

pckgs <- lapply(file_lines, function(l) { 
  if(grepl("::", l)){
    gsub(".*?([[:alnum:]\\.]+)::.*","\\1", l) 
  } else {
    return(NULL)
  }

})  
unique(unlist(pckgs))

f这里有一个函数，它可以查找像
package:：function
这样的字符串

findPackages <- function(file){
  txt <- readLines(file)
  inx <- grep('::', txt)
  txt <- txt[inx]
  m <- regexpr('[[:alnum:]]+::', txt)
  pkg <- regmatches(txt, m)
  unique(sub('::', '', pkg))
}

现在将函数应用于调用类似函数的文件

findPackages(fls[1])

以及使用bash命令找到的所有此类文件

pkgs <- lapply(fls, findPackages)
unique(unlist(pkgs))

pkgs这里有一个函数，它可以查找像
package:：function
这样的字符串

findPackages <- function(file){
  txt <- readLines(file)
  inx <- grep('::', txt)
  txt <- txt[inx]
  m <- regexpr('[[:alnum:]]+::', txt)
  pkg <- regmatches(txt, m)
  unique(sub('::', '', pkg))
}

现在将函数应用于调用类似函数的文件

findPackages(fls[1])

以及使用bash命令找到的所有此类文件

pkgs <- lapply(fls, findPackages)
unique(unlist(pkgs))

pkgs如果正则表达式出现在注释或字符串文本中，则使用正则表达式的其他解决方案也将匹配
：
。最好是解析脚本并查找解析到
pkg:：fn
操作的内容。例如：

src如果正则表达式出现在注释或字符串文本中，则使用正则表达式的其他解决方案也将匹配
：
。最好是解析脚本并查找解析到
pkg:：fn
操作的内容。例如：

src强调我真正的脚本在磁盘上，需要我没有列出的包，这一点很重要。因此，在本例中，我希望自动搜索我需要的所有包。手动阅读正是我试图避免的，但我将如何发现脚本中包含哪些包？抱歉，我可能误读了您的问题，尽管非常详细，R的检查（也使用
devtools:：CHECK
）功能性抱怨未按字面意思声明或未包含在
说明
中列出的包中的功能。必须强调的是，我的真实脚本在磁盘上，需要我没有列出的包。因此，在本例中，我希望自动搜索我需要的所有包。手动阅读正是我试图避免的，但我将如何发现脚本中包含哪些包？抱歉，我可能误读了您的问题，尽管非常详细，R的检查（也使用
devtools:：CHECK
）功能性抱怨未按字面意思声明或未包含在
说明
中列出的包中的功能。