R 随机效应点图

我有一个广义混合效应模型，如下所示：

d <- data.frame(
    g = sample(c("A","B","C","D","E"), 250, replace=TRUE),
    x = runif(250, max=100),
    y = sample(c(0,1), 250, replace=TRUE)
)

require(lme4)

fm <- lmer(y ~ x + (1 + x | g), data=d, family=binomial)

使用

dotplot（ranef（fm，postVar=TRUE）$g[，2]）

不会给我想要的东西，即使我认为应该！我已经看了

str（fm）

，但没有看到任何帮助我更接近的东西

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任何帮助和提示都将不胜感激

你只需要稍微聪明一点就可以移除另一列随机效果：

re <- ranef(fm,postVar = TRUE)
re$g$x <- NULL
dotplot(re)

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re您没有看到正确的str（）

re <- ranef(fm, postVar = TRUE)
str(re)

re这会让你非常接近。我一直想在
coefplot
中添加对
lme4
对象的支持，所以这可能是我的催化剂

theRan <- ranef(fm, postVar=TRUE)
pv <- attr(theRan$g, "postVar")
se <- pv[1, 1, ]
theIntercepts <- theRan$g[, 1, drop=F]
theFrame <- cbind(theIntercepts, se)
names(theFrame)[1] <- "Intercept"
theFrame$Low <- with(theFrame, Intercept - 2 * se)
theFrame$High <- with(theFrame, Intercept + 2 * se)
theFrame$Variable <- rownames(theFrame)
ggplot(theFrame, aes(y=Intercept, x=reorder(Variable, Intercept))) + geom_linerange(aes(ymin=Low, ymax=High), colour="black") + geom_point(, colour="blue") + coord_flip() + labs(y="Intercept", x=NULL)

theRan您的原始代码几乎达到了目的：

dotplot(ranef(fm, postVar=TRUE))$g[1]

为每个绘图释放刻度的附加提示：

dotplot(ranef(fm, postVar=TRUE),
        scales = list(x =list(relation = 'free')))

谢谢，这是一个很好的答案！
dotplot(ranef(fm, postVar=TRUE))$g[1]

dotplot(ranef(fm, postVar=TRUE),
        scales = list(x =list(relation = 'free')))