用R?(来自researchgate的x柱)
我目前有多个湖泊的物种丰度数据,以及这些湖泊的一些环境变量的测量数据。我决定对R中的数据进行规范对应分析,正如ter Braak和Verdenschot(1995)所证明的,参见链接:(部分:“环境变量重要性排序”) 我对R还不是很好,而且我没有访问文章(CANOCO)中指定的软件的权限。我的问题是,为了对环境变量的重要性进行逐步排序,我必须获得Lambda(这与Wilk的Lambda相同吗?),并在每个CCA约束轴上执行蒙特卡罗置换测试 有人知道我在R怎么做吗?我希望能够使用这种分析 如果要在当前模型中测试效果,您需要为用R?(来自researchgate的x柱),r,statistics,correlation,vegan,R,Statistics,Correlation,Vegan,我目前有多个湖泊的物种丰度数据,以及这些湖泊的一些环境变量的测量数据。我决定对R中的数据进行规范对应分析,正如ter Braak和Verdenschot(1995)所证明的,参见链接:(部分:“环境变量重要性排序”) 我对R还不是很好,而且我没有访问文章(CANOCO)中指定的软件的权限。我的问题是,为了对环境变量的重要性进行逐步排序,我必须获得Lambda(这与Wilk的Lambda相同吗?),并在每个CCA约束轴上执行蒙特卡罗置换测试 有人知道我在R怎么做吗?我希望能够使用这种分析 如果要在
cca()
提供的anova()
方法,该方法是在包中执行cca()的功能。有关详细信息,请参见?anova.cca
,可能还有测试边际条款的by=“margin”
选项
要进行逐步选择,您有两个选项
step()
函数处理CCA的类似AIC的统计信息,或ordistep()
。这通过排列测试对模型进行正向选择和反向消除测试更改有关更多详细信息,请参阅
?或步骤。这是我需要的,谢谢。我只是使用“by=”margin“使用了‘anova()’,因为我还没有弄清楚如何使‘ordistop()’正常工作。我稍后再试。