在R中自动生成模型输出

我有一个R命令列表，它首先通过RODBC从SQL数据库获取数据，计算计算字段，然后将回归模型（在我的R环境中指定为“objModel”）应用于数据。最终输出是一个csv文件，包含两列（联系人ID、概率分数）。如何使用Rscript每天自动运行脚本和检索新的csv文件？R必须一直运行吗？

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我在Windows环境下工作。我对Rscript没有任何经验。非常感谢您回答中的任何额外细节

在评论和聊天中，这个问题出现了一些不具体的情况：

1.对象持久性

objModel

是一个随时间推移而构建的~90MB模型，其中包含大量数据，无需每次重建

记住这一点，您的第一个任务是使数据在不同的R会话中持久化。只需使用

保存

和

加载

即可轻松实现。在本届会议上：

save(objModel, func1, func2, file="objModel.Rdata") # assuming a relevant directory

这假定这些是脚本所依赖的环境中唯一的依赖对象。（它可以接受任意数量的对象，因此可以根据需要添加。）

然后，您的独立脚本应该如下所示（稍后我将称之为

myscript.R

）：

代码的技巧：

• 永远不要假设人与人之间的互动
• 您是否记得保存/加载或重新创建所有需要的变量？很容易忘记脚本所依赖的当前环境中的变量，而这些变量在普通Rscript环境中是不可用的
• 有什么阴谋吗？使用

  png

  、

  pdf

  或其他方法直接保存到图像文件
• 如果您有重要步骤，请考虑异常处理（

  tryCatch

  ）
• 无论如何，在将结果写入输出文件之前，应该对结果的有效性进行简单的检查（“断言”），无论您是否写得太多。这可能很简单，如

  if（！is.null（…）

  或

  if（length（…）

2.自动化 现在，你真正的问题来了：如何在日常无监督的情况下自动执行。在通过新的命令窗口成功完成之前，不要查看cron或windows调度

也就是说，您能否运行

Rscript/path/to/myscript.R

并使其成功运行？您可能需要使用

setwd（…）

强制当前工作目录，或者在

load

和

write.csv

函数调用中使用绝对路径名。我倾向于假设调度器将从不同的目录运行东西，所以我以一种或另一种方式强制它

一旦它工作得令人满意（你检查输出CSV以确保它看起来正确吗？），现在才应该考虑实际自动化它。

3.自动化，这一次是真的。 如果您使用的是unixy操作系统（您从未指定），请查看。也许是这样的：

17 04 * * * /usr/bin/Rscript /path/to/myscript.R

它将在每天早上4:17运行命令

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如果在windows上，@MrFlick的评论是合适的：。

可能重复：。如果不是，请说明您的情况可能会有什么不同。您是使用win、mac还是unix？如果你没有赢，那么就把它作为每天跑步的起点。Rscript的使用相对简单：如果您的脚本文件名为“daily sql.R”，那么您应该安排

Rscript daily sql.R

，确保您的R脚本充分处理路径（以及文件的过度写入）和异常。@r2evans谢谢。当代码在我的R环境中使用“objModel”时，R的实例是否应该继续运行？我想你误解了：这意味着cron在每天的某个时间启动一个Rscript实例。Rscript运行您的脚本，该脚本加载/提取它需要的所有数据，进行处理，然后将CSV输出转储（到某处）。之后，Rscript退出。不需要也不需要持久的过程。@MrFlick的链接有帮助吗？你是在windows上运行这个吗？@r2evans我是在windows上运行这个。我可能没有正确地理解它，因为我担心脚本不包含创建变量“objModel”的代码。变量“objmodel”是通过训练一个大数据集创建的，它花费了很多时间。现在它驻留在我的全局环境中。我的目标是使用更小的数据集和这个“objModel”输出新的输出。当Rscript运行时，它是否需要知道“objModel”是如何创建的，或者“objModel”在全局环境中存在是否足够？这是一个非常棒的答案！再次感谢。

17 04 * * * /usr/bin/Rscript /path/to/myscript.R