R中soil.spec包中的数据格式

我想使用

soil.spec

软件包的

trans

功能，使用连续体移除来转换光谱。但我不了解原始光谱的数据格式

“原始”

功能示例为：

trans(raw, tr = "continuum removed", order = , gap = )

---

有人能给我举一个

“raw”

矩阵的例子吗？

我不得不说

土壤.spec

包在文档方面非常薄弱。但是，根据其中一个I/O工具的引用

read.spc将二进制光谱spc文件从文件夹中读取到R中 可使光谱兼容（参见make.comp中的详细信息），以 第一个采样波段或ICRAF的标准波段 光谱实验室。从扫描方法收集的信息 检查光谱的可比性。默认值已设置为ICRAF 光谱带

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我的怀疑是，假设这是一个行业标准，您需要以任何“光谱spc文件”格式保存文件。最好的办法可能是直接联系软件包维护人员。

我不得不说，

soil.spec

软件包在文档方面非常薄弱。但是，根据其中一个I/O工具的引用

read.spc将二进制光谱spc文件从文件夹中读取到R中 可使光谱兼容（参见make.comp中的详细信息），以 第一个采样波段或ICRAF的标准波段 光谱实验室。从扫描方法收集的信息 检查光谱的可比性。默认值已设置为ICRAF 光谱带

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我的怀疑是，假设这是一个行业标准，您需要以任何“光谱spc文件”格式保存文件。最好的办法可能是直接联系软件包维护人员。

我不得不说，

soil.spec

软件包在文档方面非常薄弱。但是，根据其中一个I/O工具的引用

read.spc将二进制光谱spc文件从文件夹中读取到R中 可使光谱兼容（参见make.comp中的详细信息），以 第一个采样波段或ICRAF的标准波段 光谱实验室。从扫描方法收集的信息 检查光谱的可比性。默认值已设置为ICRAF 光谱带

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我的怀疑是，假设这是一个行业标准，您需要以任何“光谱spc文件”格式保存文件。最好的办法可能是直接联系软件包维护人员。

我不得不说，

soil.spec

软件包在文档方面非常薄弱。但是，根据其中一个I/O工具的引用

read.spc将二进制光谱spc文件从文件夹中读取到R中 可使光谱兼容（参见make.comp中的详细信息），以 第一个采样波段或ICRAF的标准波段 光谱实验室。从扫描方法收集的信息 检查光谱的可比性。默认值已设置为ICRAF 光谱带

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我的怀疑是，假设这是一个行业标准，您需要以任何“光谱spc文件”格式保存文件。最好的办法可能是直接联系软件包维护人员。

要使用

soil.spec

库在光谱上获得连续去除变换，请按以下步骤进行：

准备原始光谱表并确保其列包含要转换的光谱数据。删除所有非光谱列，并确保没有缺失值

将原始光谱表的列名设置为数字格式

继续运行转换，如下所示

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raw.cw要使用

soil.spec

库在光谱上获得连续去除变换，请按以下步骤进行：

准备原始光谱表并确保其列包含要转换的光谱数据。删除所有非光谱列，并确保没有缺失值

将原始光谱表的列名设置为数字格式

继续运行转换，如下所示

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raw.cw要使用

soil.spec

库在光谱上获得连续去除变换，请按以下步骤进行：

准备原始光谱表并确保其列包含要转换的光谱数据。删除所有非光谱列，并确保没有缺失值

将原始光谱表的列名设置为数字格式

继续运行转换，如下所示

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raw.cw要使用

soil.spec

库在光谱上获得连续去除变换，请按以下步骤进行：

准备原始光谱表并确保其列包含要转换的光谱数据。删除所有非光谱列，并确保没有缺失值

将原始光谱表的列名设置为数字格式

继续运行转换，如下所示

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raw.cw对于连续介质移除，您也可以使用该软件包

如果光谱数据以吸光度单位表示，则：

crt <- continuumRemoval(X = NIRsoil$spc, type = 'A')

matplot(x = colnames(NIRsoil$spc), y = t(crt), 
        type = "l", lty = 1, 
        xlab = "Wavelengths (nm)", 
        ylab = "Absorbance (CR)",
        col = palette(gray(seq(0, 0.9, len = 25))))

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crt对于连续体移除，您也可以使用该软件包

如果光谱数据以吸光度单位表示，则：

crt <- continuumRemoval(X = NIRsoil$spc, type = 'A')

matplot(x = colnames(NIRsoil$spc), y = t(crt), 
        type = "l", lty = 1, 
        xlab = "Wavelengths (nm)", 
        ylab = "Absorbance (CR)",
        col = palette(gray(seq(0, 0.9, len = 25))))

crt对于连续体移除，您也可以使用该软件包

如果光谱数据以吸光度单位表示，则：

crt <- continuumRemoval(X = NIRsoil$spc, type = 'A')

matplot(x = colnames(NIRsoil$spc), y = t(crt), 
        type = "l", lty = 1, 
        xlab = "Wavelengths (nm)", 
        ylab = "Absorbance (CR)",
        col = palette(gray(seq(0, 0.9, len = 25))))

crt对于连续体移除，您也可以使用该软件包

如果光谱数据以吸光度单位表示，则：

crt <- continuumRemoval(X = NIRsoil$spc, type = 'A')

matplot(x = colnames(NIRsoil$spc), y = t(crt), 
        type = "l", lty = 1, 
        xlab = "Wavelengths (nm)", 
        ylab = "Absorbance (CR)",
        col = palette(gray(seq(0, 0.9, len = 25))))

crt非常感谢Andrew，我试图从我的数据中获得一个连续的去除光谱（350:2500 nm，光谱分辨率1 nm），但是结果是转换光谱，而不是CR光谱（即值介于0和1之间）。我使用了raw.cw非常感谢Andrew，我试图从我的数据中获得一个连续的去除光谱（350:2500 nm，光谱分辨率1 nm），但是结果是转换光谱，而不是CR