(biostrings)writeXStringSet错误消息-';x';必须是XStringSet对象
我正在尝试使用Biostrings函数(biostrings)writeXStringSet错误消息-';x';必须是XStringSet对象,r,fasta,writetofile,R,Fasta,Writetofile,我正在尝试使用Biostrings函数'writeXStringSet' 我的字符串是“aaaattttccgggg” 序列的名称是'name' 我试着按照剧本做 writeXStringSet(seq,width=70,format="fasta")) 但我一直得到以下错误 “x”必须是XStringSet对象 我做错了什么?询问有关Bioconductor上Bioconductor封装的问题。您有一个字符载体,但需要一个DNAStringSet(在本例中,X=DNA,但如果这是一个氨基酸序
'writeXStringSet'
我的字符串是“aaaattttccgggg”
序列的名称是'name'
我试着按照剧本做
writeXStringSet(seq,width=70,format="fasta"))
但我一直得到以下错误
“x”必须是XStringSet对象
我做错了什么?询问有关Bioconductor上Bioconductor封装的问题。您有一个字符载体,但需要一个DNAStringSet(在本例中,X=DNA,但如果这是一个氨基酸序列,也可以是AA)
很可能你想在你的序列中有名字,
c(foo=“AAA”,bar=“ATCG”)
或names(dna)=c(“foo”,“bar”)
,否则用fasta格式写就没有意义了。语言是什么?我正在用它写脚本r@Pete用R标记以增加问题可见性。一定要包括相关的标签,以增加获得回复的机会。seq
应该是同类产品。
dna = DNAStringSet(seq)