Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/1/oracle/9.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

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Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
(biostrings)writeXStringSet错误消息-';x';必须是XStringSet对象_R_Fasta_Writetofile - Fatal编程技术网

(biostrings)writeXStringSet错误消息-';x';必须是XStringSet对象

(biostrings)writeXStringSet错误消息-';x';必须是XStringSet对象,r,fasta,writetofile,R,Fasta,Writetofile,我正在尝试使用Biostrings函数'writeXStringSet' 我的字符串是“aaaattttccgggg” 序列的名称是'name' 我试着按照剧本做 writeXStringSet(seq,width=70,format="fasta")) 但我一直得到以下错误 “x”必须是XStringSet对象 我做错了什么?询问有关Bioconductor上Bioconductor封装的问题。您有一个字符载体,但需要一个DNAStringSet(在本例中,X=DNA,但如果这是一个氨基酸序

我正在尝试使用Biostrings函数
'writeXStringSet'
我的字符串是“aaaattttccgggg” 序列的名称是
'name'
我试着按照剧本做

writeXStringSet(seq,width=70,format="fasta"))
但我一直得到以下错误

“x”必须是XStringSet对象


我做错了什么?

询问有关Bioconductor上Bioconductor封装的问题。您有一个字符载体,但需要一个DNAStringSet(在本例中,X=DNA,但如果这是一个氨基酸序列,也可以是AA)


很可能你想在你的序列中有名字,
c(foo=“AAA”,bar=“ATCG”)
names(dna)=c(“foo”,“bar”)
,否则用fasta格式写就没有意义了。

语言是什么?我正在用它写脚本r@Pete用R标记以增加问题可见性。一定要包括相关的标签,以增加获得回复的机会。
seq
应该是同类产品。
dna = DNAStringSet(seq)