在R中使用rarecurve（）时出错

我在社区数据上使用vegan:：rarecurve

lac.com.data<-wisconsin(lac.com.data)
rarecurve(lac.com.data)

无济于事

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我已经生成了一个tabasco（）图，并在数据框上执行了威斯康星州标准化，没有任何问题。

没有可复制的示例。然而，你的用法是错误的。函数

rarecurve

需要输入计数数据：它从每个采样单元（行）中采样个体，因此您必须拥有个体数据。该错误是由使用威斯康星州（lac.com.data）引起的：之后所有

行和（lac.com.data）

将为

1

，并且您的数据为非整数。不能将

rarecurve

用于

wisconsin（）

转换数据或任何其他非整数数据。这里出现错误是因为估计的个体数（转换数据的行和均为1）低于物种数（>1）

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显然，我们需要在

rarecurve

中检查输入。我们假设人们会知道需要什么样的输入，但我们错了。

请在输入数据中加入一个示例。感谢Jari的回复。我尝试在没有威斯康星州标准化的情况下运行它（即在整数计数的原始列联矩阵上），但遇到了同样的问题。有没有一种有效的方法可以上传一个大的列联表，这样我就可以显示我的lac.com.data数据框是什么样子的？您的消息中没有任何内容表明输入矩阵的大小存在问题。你真的应该尽量少举一个失败的例子。我敢打赌，如果你举一个这样小的例子，你就能自己找出问题所在。所以请尝试一下。如果得到与矩阵中完全相同的错误消息，那么我会看到两个潜在的问题：您确实有非整数数据，或者您有空的观察值（一些

行和

为零）。如果您收到其他错误消息，则问题可能不同。我不知道，因为你不告诉我。谢谢。这是因为我有几行的总和为零。我并不是说矩阵的大小导致了函数失效。我只是想向您展示我使用的导致问题的数据帧。然而，我不知道/不想在这里发布51x54数据帧，我想问，为了将来的知识，如何以有效的方式这样做，以便潜在的响应者可以看到输入，而不必在我最初的问题文本中有一个大的、格式笨拙的数据帧。我现在看到了MrFlick链接到的链接，这非常有用。我的一个问题是，如果我只选择了一些行，或者选择了适当的数据，那么错误可能不会像我运行整个数据帧时那样出现，因为只有两行都是零。尽管如此，贾里还是解决了我的问题。谢谢大家。贾里，我希望你能再回答一个问题，因为我这里有你和你丰富的知识。我希望使用

rarecurve（）

查看我在不同土地管理类型中是否进行了足够的计数。我目前有5种类型，每种10个样品。是否有一种方法（参数）可以使用

rarecurve（）

（编辑函数本身）使每个管理类型在输出图中是一条单独的线，或者我必须对每个管理类型求和（因此我只有5行，每种类型1行），然后在编辑的数据帧上运行“rarecurve（）”？谢谢

 rarecurve(lac.com.data,step=1)