R 从GatingSet导出FCS文件

我正在尝试对

流程集

进行选通，获取

选通集

，然后将其导出到单独的FCS文件中，该文件应仅包含我选择选通的数据。我的命令如下：

使用我想要的名称读取FCS文件

s <- read.flowSet(path = path,files = secondary_datasets,
                  transformation = FALSE, sep="\t")

问题是我新创建的FCS文件（1_测试、2_测试）与预先选通的文件相同。我可以看到

flowSet

中的文件被正确加载，并且选通没有给我任何错误，所以我猜它也可以正常工作，因为它是几行代码。我错过了什么？

gs@data

给我选通的

流程集

？如果没有，我怎么能得到它

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对不起，如果我没有把我的问题说清楚，我不是生物学家。

如果没有实际的数据集，你的问题有点难以回答，我理解。一般来说，我会确保通读R/Bioconductor flow包中的工作示例，特别注意示例数据集与您的数据集或数据对象（在R中）之间的差异。祝你好运。没有实际的数据集，你的问题有点难以回答，我理解。一般来说，我会确保通读R/Bioconductor flow包中的工作示例，特别注意示例数据集与您的数据集或数据对象（在R中）之间的差异。祝你好运

gs <- GatingSet(fs)
bf <- rectangleGate(filterId=id, .gate=mat)
add(gs, bf, parent=parent)
recompute(gs)

write.flowSet(gs@data,outdir = path,"test")