合并R中的文件并保留我匹配的列？

我有两个巨大的数据表：

> head(x)
          gene_id chr  min_POS  max_POS     rs_id pvalue_G pvalue_E     metaP
1 ENSG00000047849   3 47568061 48143776  rs319690   0.7139   0.8613 0.7019270
2 ENSG00000047849   3 47568061 48143776 rs4392441   0.5452   0.7074 0.4881783
3 ENSG00000047849   3 47568061 48143776 rs4858887   0.5435   0.7074 0.4870446
4 ENSG00000047849   3 47568061 48143776 rs7651237   0.8621   0.6440 0.6529929
5 ENSG00000047849   3 47568061 48143776 rs6803741   0.5436   0.6612 0.4596804
6 ENSG00000047849   3 47568061 48143776 rs4858881   0.6142   0.6833 0.5189457
...

> head(b)
          V2        V3    V4 V5 V6
1: 194857581 194857582 rs224  0  -
2: 194857560 194857561 rs225  0  -
3:   7864903   7864904 rs226  0  +
4:   7864919   7864920 rs227  0  +
5:   5558441   5558442 rs228  0  +
6: 137923628 137923629 rs229  0  +
...

我正在尝试使用以下方法合并它们：

x1=merge(b, x, by.x = "V4", by.y="rs_id")

问题是我想保留我合并的所有V4和rs_id。这个合并在x1中给了我89行，我希望有一个额外的列，其中包含所有匹配的V4和rs_id

另外，b文件是巨大的，所以任何更有效的方法都是受欢迎的

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基本上，我需要在V4和rs_id上匹配x和b，我需要保留在最终数据帧中的列是：gene_id、chr、rs_id（匹配）、pvalue_G、pvalue_E、V2、V3。

为此尝试使用包dplyr。我希望这是真正的代码，但没有运行它，因为我没有数据帧

基本上，我们使用x和b进行内部联接（因此只保留具有匹配的rs_ID和V4的行），然后选择所需的列

图书馆（dplyr）

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嗨，我得到：>x%>%+内部连接（b，by=c（“rs\u id”=“V4”）%>%+选择（gene\u id，chr，rs\u id，pvalue，G，pvalue，E，V2，V3）错误：意外输入：“内部连接（b，by=c（“rs\u id”=“V4”）%>%select（gene\u id，chr，rs\u id，pvalue，“哎哟，我想我错过了一个结束语”）。现在编辑它。>x%>+内部连接（b，by=c（“rs\u”）%%>%%+select（gene_-id，chr，rs_-id，pvalue，G，pvalue，E，V2，V3）错误：在“内部连接（b，by=c（“rs_-id”=“V4”））%%>%select（gene_-id，chr，rs_-id，pvalue）”中输入了意外信息：by=c（“rs_-id”=“V4”）哦，再次抱歉…pvalue后面的逗号，加载数据，测试数据，应该可以工作。您的标题集没有重叠的ID，因此我得到0行。建议在代码标记中发布预期的输出。

x %>%
  inner_join(b, by = c("rs_id" = "V4")) %>%
  select(gene_id, chr, rs_id, pvalue_G, pvalue_E, V2, V3)