将VSN归一化方法应用于安捷伦微阵列数据在R
我正在使用R处理单通道安捷伦基因表达微阵列数据。读取原始数据后,我想用VSN或vsnrma标准化方法对其进行标准化。这是我应用的代码-将VSN归一化方法应用于安捷伦微阵列数据在R,r,R,我正在使用R处理单通道安捷伦基因表达微阵列数据。读取原始数据后,我想用VSN或vsnrma标准化方法对其进行标准化。这是我应用的代码- targets<-readTargets("Targets.txt",sep="") x <- read.maimages(targets$FileName, source="agilent.median", green.only=TRUE) y <- normalizeBetweenArrays(x, method="vsn") 你知
targets<-readTargets("Targets.txt",sep="")
x <- read.maimages(targets$FileName, source="agilent.median", green.only=TRUE)
y <- normalizeBetweenArrays(x, method="vsn")
你知道这是什么意思吗?我怎样才能解决这个问题?
提前感谢。有一个独立的功能。使用以下代码:
y <- normalizeVSN(x)
y如果这里没有有用的答案,您可以尝试在支持论坛上提问;这似乎是一个自然的话题。
y <- normalizeVSN(x)