更新R:`update.packages`vs.`install.packages中的包`

我试图加载

参与方

库，但出现以下错误：

 Loading required package: zoo
 Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 
   namespace ‘lattice’ 0.20-24 is already loaded, but >= 0.20.27 is required
 Error: package ‘zoo’ could not be loaded

因此我决定更新同一会话（）中的所有包，包括

lattice

，希望

zoo

和

party

在

lattice

更新后能够正确加载：

 pkgs <- names( sessionInfo()$otherPkgs )
 pkgs <- paste('package:', pkgs, sep = "")
 lapply( pkgs , detach, character.only = TRUE, unload = TRUE)
 update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE,
                 repos="http://r-forge.r-project.org",
                 oldPkgs=c("lattice","zoo","party")
 )

根据我的建议，最好在我想要更新的软件包上运行

install.packages

，然后重新启动。事实上，它成功了

---

所以问题是：

update.packages

什么时候需要，因为在运行的会话中进行更新至少是脆弱的，而

install.packages

将以重新启动会话为代价来实现这一点？我错过了什么

R

包管理巫术？谢谢。

这是我喜欢在当前工作会话之外启动“安装”和“更新”操作的另一个原因

---

通过使用命令行，我可以在没有加载包的情况下获得新的R会话，并且不会出现您在这里遇到的问题。作为一种快捷方式，我定义脚本

update.r

和

install.r

使用（并包含在该软件包的

examples/

目录中），但您当然可以通过Rscript执行相同的操作。

Dirk提供了一种更通用的策略来避免此问题。但是，如果您处于一个不想重新启动的交互式会话中，并且希望卸载一个需要更新的包（这既不是

分离（.）

-ing，也不是

更新.packages（.）

-ing有效地完成），那么有一个函数，

unloadNamespace

通常对我有效。在它的帮助页面上有警告说它不完全安全，但我没有遇到任何困难。尝试：

unloadNamespace("lattice")   # or lapply()-ing as you attempted with `detach`
update.packages("lattice")
require(lattice)  # or library()

unloadNamespace("lattice")   # or lapply()-ing as you attempted with `detach`
update.packages("lattice")
require(lattice)  # or library()