R 在单片眼镜中对单元数据集进行子集设置

如果任何人有在R中使用单片眼镜组件的经验：

我试图根据样本名称向量对数据进行子集划分，但我无法完成

我试过：

x@phenoData$sampleNames <- example.cells

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x@phenoData$sampleNames此：
x@phenoData$sampleNames根据使用此代码过滤的低质量细胞（HSSM是单眼对象）：

或者（直接从Seurat获得）：

好的，我发现我可以用x。对不起，我不熟悉修拉。考虑到复杂的数据结构，我想作者会构建一个过滤器/子集函数来删除低质量的样本，您可以使用这些样本，但您必须检查文档。
valid_cells <- row.names(subset(pData(HSMM),
            Cells.in.Well == 1 &
            Control == FALSE &
            Clump == FALSE &
            Debris == FALSE &
            Mapped.Fragments > 1000000))
HSMM <- HSMM[,valid_cells]

x = x[,example.cells]

x = x[,rownames(data.seurat@meta.data[data.seurat@meta.data$CellType == "interesting_cell",])]