R在尝试编译时抛出错误

我尝试使用R生成2个文件第一个文件实际上生成的非常好，但第二个文件告诉我：

conteo_correlaciones.c:3:15:错误：R.h:没有这样的文件或目录 conteo_correlaciones.c:4:24:错误：Rinternals.h:没有这样的文件或 目录conteo_correlaciones.c:31:错误：应为“=”、“、”、“；”， “countcorrelations”之前的“asm”或“属性”

R.h和Rinternals.h都是从R目录中复制的，它们与其余文件位于同一目录中，但我无法克服此错误，这些文件由包含调用，如下所示：

#include <R.h>
#include <Rinternals.h>

这非常有效，并为我生成了正确的文件和：

gcc -dynamiclib conteo_correlaciones.c -o conteo_correlaciones.so

这让我想起了前面提到的错误。知道会是什么吗

你必须改变

#include <R.h>
#include <Rinternals.h>

如果头文件与代码文件位于同一目录中。 或者您可以将正确的include路径添加到gcc命令行（例如，

-I/usr/share/R/include

）。

您必须更改

#include <R.h>
#include <Rinternals.h>

如果头文件与代码文件位于同一目录中。

---

或者您可以将正确的include路径添加到gcc命令行（例如，

-I/usr/share/R/include

）。

R CMD SHLIB

添加所有适当的标志以编译代码。你不能（可靠地）手工编译你的代码

R CMD SHLIB

已经创建了所有必要的文件，因此您不需要自己运行

gcc

例如，这就是

R CMD SHLIB

运行的内容：

$ R CMD SHLIB foo.c
gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include 
  -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include/x86_64 
  -I/usr/local/include    -fPIC  -g -O2 -c foo.c -o foo.o
gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names
  -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress
  -L/usr/local/lib -o foo.so foo.o -F/Library/Frameworks/R.framework/..
  -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation

如您所见，创建正确的二进制文件需要一长串标志。第一行是编译，第二行是链接。正如你所看到的，它甚至与你试图“用手”做的事情并不接近

---

至于确切的错误-这只是您将得到的众多错误之一-在上述情况下，您需要使用

-I

包含R的include路径。还有其他的，所以你不想去那里，只要坚持使用

R CMD SHLIB

R CMD SHLIB

添加所有合适的标志来编译你的代码。你不能（可靠地）手工编译你的代码

R CMD SHLIB

已经创建了所有必要的文件，因此您不需要自己运行

gcc

例如，这就是

R CMD SHLIB

运行的内容：

$ R CMD SHLIB foo.c
gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include 
  -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include/x86_64 
  -I/usr/local/include    -fPIC  -g -O2 -c foo.c -o foo.o
gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names
  -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress
  -L/usr/local/lib -o foo.so foo.o -F/Library/Frameworks/R.framework/..
  -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation

如您所见，创建正确的二进制文件需要一长串标志。第一行是编译，第二行是链接。正如你所看到的，它甚至与你试图“用手”做的事情并不接近

---

至于确切的错误-这只是您将得到的众多错误之一-在上述情况下，您需要使用

-I

包含R的include路径。还有其他的，所以你不想去那里，只要坚持使用

R CMD SHLIB

首先定位R.h的存储位置（它可以在/usr/include或/usr/local/include中，如果R是从源代码安装的，也可以在任何地方）。在我的例子中，它位于/home/user/R/include/：

然后导出路径：

export CPATH=/home/user/R/include/
export C_INCLUDE_PATH=/home/user/R/include/
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/home/user/R/include/
export GCC_INCLUDE_DIR=/home/user/R/include/

---

然后编译应该可以正常运行。

首先找到R.h的存储位置（它可以位于/usr/include或/usr/local/include中，如果R是从源代码安装的，则可以位于任何位置）。在我的例子中，它位于/home/user/R/include/：

然后导出路径：

export CPATH=/home/user/R/include/
export C_INCLUDE_PATH=/home/user/R/include/
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/home/user/R/include/
export GCC_INCLUDE_DIR=/home/user/R/include/

然后编译应该可以正常运行