Windows 7:通过脚本安装多个R软件包

我正在尝试在Windows7上为R2.15.1的安装编写脚本。R安装很好，但我不知道如何从同一批脚本（或任何批脚本）安装多个包。下面是我调用简单R文件的脚本部分

"%ProgramFiles%\R\R-2.15.1\bin\R.exe" CMD BATCH "%~dp0R packages for GME.R"

下面是“R packages for GME.R”的内容，其中包含要安装的包

install.packages("CircStats","coda","deldir","gplots","igraph","ks","odesolve","RandomFields",dep=TRUE)

鉴于此，我尝试了以下方法：

取得“C:\Program Files\R\R-2.15.1\library”的所有权，然后运行

R CMD BATCH

（无更改）

将“完全控制”权限授予同一文件夹上的我的用户帐户，然后运行

R CMD BATCH

（无更改）

通过Rprofile.site将库文件夹更改到另一个位置，然后运行

R CMD BATCH

（无更改）

通过Rgui

install.packages（“CircStats”、“coda”、“deldir”、“gplots”、“igraph”、“ks”、“odesolve”、“RandomFields”、dep=TRUE）”运行命令。

（有效）

到目前为止，我还没有使用CMD或批处理脚本来安装软件包。有什么我遗漏的吗？如有任何脚本包安装的替代方法，将不胜感激

此外，我将要安装的机器适用于多个用户，因此系统范围的安装和配置是首选

//

编辑2012-11-06： 以下是.Rout文件中的错误消息：

install.packages("CircStats","coda","deldir","gplots","igraph","ks","odesolve","RandomFields",dep=TRUE)
Warning in install.packages("CircStats", "coda", "deldir", "gplots", "igraph",  :
  'lib = "coda"' is not writable
Error in install.packages("CircStats", "coda", "deldir", "gplots", "igraph",  : 
  unable to install packages
Execution halted

---

如果我随后执行

library（coda）

，它会在library（coda）中给出

错误：没有名为“coda”的包

odesolve包被折旧，并被deSolve替换。遇到此包时，R2.15.1抛出错误。这可能会给你带来麻烦。下面是一个脚本，我用于安装新R安装的软件包

libs=c("CircStats","coda","deldir","gplots","igraph","ks","odesolve‌​","RandomFields")
type=getOption("pkgType")                           
    CheckInstallPackage <- function(packages, repos="http://cran.r-project.org",
       depend=c("Depends", "Imports", "LinkingTo", "Suggests", "Enhances"), ...) {
         installed=as.data.frame(installed.packages())
    for(p in packages) {
        if(is.na(charmatch(p, installed[,1]))) { 
          install.packages(p, repos=repos, dependencies=depend, ...) 
                    }
      }
    } 
    CheckInstallPackage(packages=libs)

libs=c（“CircStats”、“coda”、“deldir”、“gplots”、“igraph”、“ks”、“odesolve‌​","随机字段“）
type=getOption（“pkgType”）
CheckInstallPackageodesolve软件包已折旧，并已被deSolve取代。遇到此包时，R2.15.1抛出错误。这可能会给你带来麻烦。下面是一个脚本，我用于安装新R安装的软件包

libs=c("CircStats","coda","deldir","gplots","igraph","ks","odesolve‌​","RandomFields")
type=getOption("pkgType")                           
    CheckInstallPackage <- function(packages, repos="http://cran.r-project.org",
       depend=c("Depends", "Imports", "LinkingTo", "Suggests", "Enhances"), ...) {
         installed=as.data.frame(installed.packages())
    for(p in packages) {
        if(is.na(charmatch(p, installed[,1]))) { 
          install.packages(p, repos=repos, dependencies=depend, ...) 
                    }
      }
    } 
    CheckInstallPackage(packages=libs)

libs=c（“CircStats”、“coda”、“deldir”、“gplots”、“igraph”、“ks”、“odesolve‌​","随机字段“）
type=getOption（“pkgType”）
CheckInstallPackage当您通过命令行执行时，它是如何“工作”的？它给你一个错误？它告诉您它已经成功了，但当您启动R和
库（CircStats）
时，它会说它没有安装？如果您收到某种错误消息，什么错误？我想您忘了将包名列表包装在
c（）
中。尝试
install.packages（c（“CircStats”、“coda”、“deldir”、“gplots”、“igraph”、“ks”、“odesolve”、“RandomFields”），dep=TRUE）
I将.Rout中的错误消息添加到上面的原始问题中。以这种方式调用
install.packages（）
时，R似乎无法写入库。当您通过命令行执行此操作时，它是如何“工作”的？它给你一个错误？它告诉您它已经成功了，但当您启动R和
库（CircStats）
时，它会说它没有安装？如果您收到某种错误消息，什么错误？我想您忘了将包名列表包装在
c（）
中。尝试
install.packages（c（“CircStats”、“coda”、“deldir”、“gplots”、“igraph”、“ks”、“odesolve”、“RandomFields”），dep=TRUE）
I将.Rout中的错误消息添加到上面的原始问题中。这样调用
install.packages（）
时，R似乎无法写入库。太好了！当从上述批处理脚本调用时（
R CMD batch
）。第2行有一个小语法错误：
type=getOption（“pkgType”）
应该是
type=getOption（“pkgType”）
（单括号）。太好了！当从上述批处理脚本调用时（
R CMD batch
）。第2行有一个小语法错误：
type=getOption（“pkgType”）
应该是
type=getOption（“pkgType”）
（单括号）。