R x轴上带有时间的过渡(Sankey)绘图
我有一个过渡矩阵,如下所示:R x轴上带有时间的过渡(Sankey)绘图,r,plot,transition,sankey-diagram,networkd3,R,Plot,Transition,Sankey Diagram,Networkd3,我有一个过渡矩阵,如下所示: 1. A A B 2. B C A 3. A C C 其中,每列表示句点,每行表示代理,每个字母表示状态。我想创建一个绘图,例如显示每个时期从状态到状态的转换。 特工的身份并不重要所以我想要一个这样的图: 我可以使用networkD3或googleVis软件包。然而,由于每个节点的位置是由包内生决定的,所以我不知道如何将时间方面放在X轴上 如有任何帮助或其他可视化建议,我们将不胜感激, 提前多谢了 您可以通过以下方式复制样本数据: tr
1. A A B
2. B C A
3. A C C
其中,每列表示句点,每行表示代理,每个字母表示状态。我想创建一个绘图,例如显示每个时期从状态到状态的转换。
特工的身份并不重要所以我想要一个这样的图:
我可以使用networkD3或googleVis软件包。然而,由于每个节点的位置是由包内生决定的,所以我不知道如何将时间方面放在X轴上 如有任何帮助或其他可视化建议,我们将不胜感激, 提前多谢了 您可以通过以下方式复制样本数据:
transitiondata <- data.frame("t1"=c("A","B","A"),
"t2"=c("A","C","C"),
"t3"=c("B","A","C"))
transitiondata来自未来的自动应答:gg
包,非常适合此任务,是在这段时间开发的。为了使用它,我们需要提供整洁的数据
让我们加载所需的库:
library(ggplot2)
library(ggalluvial)
library(tidyr)
library(dplyr
然后,在我们将数据转换为整洁的格式之前,需要为数据创建标识符。因此,新数据如下所示:
transitiondata$id <- c("id1","id2","id3")
而ggplot2
和ggplot2
起到了关键作用:
ggplot(transitiondata_tidy,
aes(x = time, stratum = state, alluvium = id, fill = state, label = state)) +
geom_stratum() +
geom_text(stat = "stratum", size = 3) +
geom_flow(fill = "darkgrey", color = "black")
我们的过渡(Sankey)图已经准备好:
id time state
1 id1 t1 A
2 id2 t1 B
3 id3 t1 A
4 id1 t2 A
5 id2 t2 C
6 id3 t2 C
7 id1 t3 B
8 id2 t3 A
9 id3 t3 C
ggplot(transitiondata_tidy,
aes(x = time, stratum = state, alluvium = id, fill = state, label = state)) +
geom_stratum() +
geom_text(stat = "stratum", size = 3) +
geom_flow(fill = "darkgrey", color = "black")