由于macOS 10.12.3和10.12.5上缺少zlib，R无法安装devtools或git2r

我试图在R3.3.2中安装两个软件包：devtools和git2r。它们取决于zlib的存在。这是macOS Sierra 10.12.3附带的，默认为1.2.8版。 当我试图安装这些软件包时，会出现以下错误

我一直在尝试很多事情

通过RStudio中的CRAN直接安装：无效。 试图在macOS上找到zlib:找不到zlib。 通过R CMD安装git2r:无效。 我注意到有人在GitHub上发布了类似的问题：。目前还没有解决办法

这里有人有主意吗

谢谢

砂光机

下面是错误消息

在/private/tmp/RtmpP6HZFx/R.INSTALLe73412909267/git2r中配置错误

配置错误

找不到构建git2r所需的zlib库

请安装：

例如Debian和Ubuntu上的zlib1g开发包

如Fedora、CentOS和RHEL上的zlib-devel软件包

然后再试一次

如果系统上安装了zlib库，但git2r配置找不到它，则可以使用以下命令指定zlib的include和lib路径：

R CMD安装-configure args='-带zlib include=include_PATH-带zlib lib=lib_PATH'git2r

有关更多详细信息，请参阅config.log

错误：包git2r的配置失败

*删除/usr/local/lib/R/3.3/site-library/git2r

更新：macOS X 10.12.5与R 3.4.0结合使用时，同样的问题仍然存在——我需要后者来支持DESeq2。

解决方案…嗯。不是真的。我只是卸载了R和所有的软件包，然后又重新安装了所有的东西。我通过自制软件安装了R和RStudio，并遵循以下说明：

奇怪的是：所有问题都消失了

更新1：这个解决方案显然不适用于R3.4.0和macOS X 10.12.5的组合。我们需要解决这个问题

更新2：我发现了我认为存在的问题：xcode命令行工具的错误路径

sudoxcode-select-reset完成了这个技巧，现在xcode-select-p指向/Library/Developer/CommandLineTools。以及哪个xcode select指向/usr/bin/xcode select。通过谷歌搜索，我发现不需要通过App Store安装Xcode，因为它在：

在早期版本的macOS上，安装Xcode命令行工具更加困难。它需要从Mac应用商店大量下载完整的Xcode软件包，或者注册为一个较小的命令行工具包的苹果开发者。Mac OS X Mavericks使Xcode命令行工具的安装更加简单。

解决方案…嗯。不是真的。我只是卸载了R和所有的软件包，然后又重新安装了所有的东西。我通过自制软件安装了R和RStudio，并遵循以下说明：

奇怪的是：所有问题都消失了

更新1：这个解决方案显然不适用于R3.4.0和macOS X 10.12.5的组合。我们需要解决这个问题

更新2：我发现了我认为存在的问题：xcode命令行工具的错误路径

sudoxcode-select-reset完成了这个技巧，现在xcode-select-p指向/Library/Developer/CommandLineTools。以及哪个xcode select指向/usr/bin/xcode select。通过谷歌搜索，我发现不需要通过App Store安装Xcode，因为它在：

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在早期版本的macOS上，安装Xcode命令行工具更加困难。它需要从Mac应用商店大量下载完整的Xcode软件包，或者注册为一个较小的命令行工具包的苹果开发者。Mac OS X Mavericks使Xcode命令行工具的安装更加简单。

我也遇到了同样的问题。我有一张便条。只需从那里安装zlib。

我也遇到了同样的问题。我有一张便条。只需转到并从那里安装zlib。

您需要安装Xcode和命令行实用程序，以便头文件显示在/usr/include中。这就是问题：这些都已安装……您需要安装Xcode和命令行实用程序，以便头文件显示在/usr/include中。这就是问题：这些是安装。。。