无法从R中的gamm模型提取logLik
也许是个愚蠢的问题,但经过几个小时的寻找,我仍然没有找到解决办法。 我运行了一个gamm模型,该模型似乎运行良好。现在我想使用在模型中计算的对数似然来计算模型的AIC(mod1) 模型运行如下所示无法从R中的gamm模型提取logLik,r,gam,R,Gam,也许是个愚蠢的问题,但经过几个小时的寻找,我仍然没有找到解决办法。 我运行了一个gamm模型,该模型似乎运行良好。现在我想使用在模型中计算的对数似然来计算模型的AIC(mod1) 模型运行如下所示 mod1<-gamm(Biomass..g. ~ Atoll + SizeCm + Depth + OuterOrLagoon,random=list(SiteID=~1),family=gaussian,data=RMI2014, method = "REML") 起初我认为这是错误的,因为
mod1<-gamm(Biomass..g. ~ Atoll + SizeCm + Depth + OuterOrLagoon,random=list(SiteID=~1),family=gaussian,data=RMI2014, method = "REML")
起初我认为这是错误的,因为我使用的是REML而不是最大似然,但在不使用REML时返回相同的错误
是因为gamma中有一个随机因子,所以返回了错误吗
请帮忙
干杯,泰森根据,调用gamm
的结果是一个列表,其中包含两个类型为gam
和lme
的对象
您可以获得lme车型的AIC和logLik,例如:
AIC(mod1$lme)
我对gamm模型了解不够,无法判断这是否等同于您所追求的(您可能希望重新发布)
AIC(mod1$lme)