如何直接从Github编译R包二进制文件?
如何直接从Github编译R包二进制文件?,r,binaryfiles,devtools,r-package,R,Binaryfiles,Devtools,R Package,devtools包提供了通过install\u Github命令直接从Github安装包的可能性 使用devtoolspackage中的build命令,可以从本地文件夹编译R包二进制文件 也可以使用build直接从Github文件夹编译(而不是安装)R包二进制文件,例如build(“https://github.com/user/rpackage“?有趣的问题。我不知道有一个函数是为此目的构建的,但这并不意味着它不可能实现。我根据从devtools包中学习的几个非导出函数编写了一个函数 # de
devtools
包提供了通过install\u Github
命令直接从Github安装包的可能性
使用devtools
package中的build
命令,可以从本地文件夹编译R包二进制文件
也可以使用
build
直接从Github文件夹编译(而不是安装)R包二进制文件,例如build(“https://github.com/user/rpackage“
?有趣的问题。我不知道有一个函数是为此目的构建的,但这并不意味着它不可能实现。我根据从devtools
包中学习的几个非导出函数编写了一个函数
# devtools:::git_remote
# devtools:::remote
# devtools:::install_remotes
# devtools:::try_install_remote
# devtools:::install_remote
# devtools:::install
# devtools:::R
# devtools:::remote_download.git_remote
功能build\u from_git
需要安装devtools
和git2r
。此函数将获取git服务器上托管的R包的url,创建临时目录,克隆repo,构建包,将.tar.gz移动到工作目录,然后删除临时文件
请注意,我在这项工作中经常使用:
,通常不推荐使用手册中提到的方法。然而,当您需要/想要使用来自另一个包的非导出函数时,这是一种合理的编程方法。参数与devtools::install\u git
中的参数相同
build_from_git <- function(url, subdir = NULL, branch = NULL, credentials = NULL, progress = interactive()) {
grmt <- devtools:::git_remote(url, subdir = subdir, branch = branch, credentials = NULL)
bundle <- "__temp__"
git2r::clone(grmt$url, bundle, credentials = grmt$credentials, progress = progress)
if (!is.null(grmt$branch)) {
r <- git2r::repository(bundle)
git2r::checkout(r, grmt$branch)
}
on.exit(unlink(bundle, recursive = TRUE), add = TRUE)
sourcepkg <- devtools::as.package(devtools:::source_pkg(bundle, subdir = grmt$subdir))
on.exit(unlink(sourcepkg, recursive = TRUE), add = TRUE)
devtools:::R("CMD build . ", path = "__temp__")
system("mv __temp__/*.tar.gz .")
}
您应该在工作目录中看到.tar.gz
文件
上述工作的会话信息为:
> sessionInfo()
R version 3.4.1 (2017-06-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Debian GNU/Linux 9 (stretch)
Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3
LAPACK: /usr/lib/libopenblasp-r0.2.19.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.1 withr_1.0.2 memoise_1.1.0 git2r_0.19.0
[5] digest_0.6.12 devtools_1.13.2
没有检查是否可能,但是下载包并在本地构建它有什么缺点吗?在R中只需一个命令就可以更方便地完成。
> sessionInfo()
R version 3.4.1 (2017-06-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Debian GNU/Linux 9 (stretch)
Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3
LAPACK: /usr/lib/libopenblasp-r0.2.19.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.1 withr_1.0.2 memoise_1.1.0 git2r_0.19.0
[5] digest_0.6.12 devtools_1.13.2