无法在SBMLR(Bioconductor)中加载SBML.xml文件
我已经从这里下载了biomd000000175.xml文件。我试着用无法在SBMLR(Bioconductor)中加载SBML.xml文件,r,xml,bioconductor,sbml,R,Xml,Bioconductor,Sbml,我已经从这里下载了biomd000000175.xml文件。我试着用 library(SBMLR) mapk <- readSBML("BIOMD0000000175.xml") > summary(mapk) Error in x$law(S0[c(x$reactants, x$modifiers)], x$parameters) : object 'membrane' not found 库(SBMLR) mapk摘要(mapk) x$定律中的错误(S0[c(x$反应物,x$
library(SBMLR)
mapk <- readSBML("BIOMD0000000175.xml")
> summary(mapk)
Error in x$law(S0[c(x$reactants, x$modifiers)], x$parameters) :
object 'membrane' not found
库(SBMLR)
mapk摘要(mapk)
x$定律中的错误(S0[c(x$反应物,x$修饰物)],x$参数):
找不到对象“膜”
任何帮助都将不胜感激。您应该指定它来自Bioconductor。它看起来像pkg中的一个bug,我会向作者报告。虽然这不是关于为什么SBMLR中存在OP问题的答案,但我想提及的是,SBML还有第二个R接口。它是libSBML的一部分。有关安装libSBML R接口的说明,请访问。我还没有尝试过这种特定的模式,但它应该工作。(完全披露:我是SBML和libSBML的开发人员。)