在包GEOquery中使用getGEO（）时出错

我正在R中运行以下代码：

library(GEOquery)
mypath <- "C:/Users/Farzin/Desktop/BIOC"
GDS1 <- getGEO('GDS1',destdir=mypath)

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有人能告诉我如何消除这个错误吗？

我在使用GEOquery 2.23.5版本和Ubuntu12.04中的R和Bioconductor时遇到了同样的错误，不管我查询的是什么GDS文件。可能是GEOquery软件包有问题吗？

无论我查询的是什么GDS文件，我使用的GEOquery版本2.23.5和Ubuntu12.04中的R和Bioconductor都有相同的错误。可能是GEOquery包有问题吗？

以我的经验，getGEO非常挑剔。我经常遇到连接到GEO服务器的问题。如果在下载过程中发生这种情况，getGEO会留下一个部分文件。但是，由于存在部分文件，当您尝试重新下载时，它将使用此缓存的部分下载文件，并会遇到您希望看到的错误，因为它不是完整文件

要解决这个问题，请删除缓存的软文件，然后重试下载。

根据我的经验，getGEO非常挑剔。我经常遇到连接到GEO服务器的问题。如果在下载过程中发生这种情况，getGEO会留下一个部分文件。但是，由于存在部分文件，当您尝试重新下载时，它将使用此缓存的部分下载文件，并会遇到您希望看到的错误，因为它不是完整文件

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要解决此问题，请删除缓存的软文件，然后重试下载。

也许您可以在示例文件中添加更多上下文？或者试试？也许你可以在一个示例文件中添加更多的上下文？还是试试？

Using locally cached version of GDS1 found here:
C:/Users/Farzin/Desktop/BIOC/GDS1.soft.gz 
Error in read.table(con, sep = "\t", header = FALSE, nrows = nseries) : 
  invalid 'nlines' argument