如何在biomaRt-R软件包中使用NCBI基因数据库

如何在biomaRt-R软件包中使用NCBI基因数据库,r,ncbi,biomart,R,Ncbi,Biomart,我不是R方面的专家,但我正在尝试学习如何使用biomaRt软件包来发现位于我感兴趣区域的基因 我已经使用ensembl数据集和以下代码生成了有效的输出: > mart= useMart(biomart="ensembl",dataset="hsapiens_gene_ensembl") > results <- getBM(attributes =c("chromosome_name","start_position","end_position", "band","hgnc_

我不是R方面的专家,但我正在尝试学习如何使用biomaRt软件包来发现位于我感兴趣区域的基因

我已经使用ensembl数据集和以下代码生成了有效的输出:

> mart= useMart(biomart="ensembl",dataset="hsapiens_gene_ensembl")
> results <- getBM(attributes =c("chromosome_name","start_position","end_position",
"band","hgnc_symbol","entrezgene"), filters = c("chromosome_name","start","end"),
values = list(1,226767027,227317593), mart=mart)
>mart=useMart(biomart=“ensembl”,dataset=“hsapiens\u gene\u ensembl”)
>结果键入
listtributes(mart)
以查看可选择的属性列表


关于基因名称,我想您可能需要
外部基因id
,但也有其他基因名称选项。

谢谢!我尝试了
external\u gene\u id
,但我可能弄错了什么。现在它正按照我的要求工作。