“如何安装R软件包”；RNetCDF“；及；ncdf“；在Ubuntu上？

我想在Ubuntu中使用R包RNetCDF和ncdf

当我尝试

install.packages（'RNetCDF'）

或

install.packages（'ncdf'）

时，我会遇到类似的错误：

...
ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [ncdf.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’
...
Warning message:
In install.packages("ncdf") :
  installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status

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Ubuntu存储库中的包

libnetcdf6

和

netcdf-bin

已安装。我还需要做点别的吗

您需要安装这些包的

-dev

，以获取编译包所需的头文件。在本例中，您需要

libnetcdf-dev

，

udunits-bin

和

libudunits2-dev

，在我的示例中，需要libudunits2-dev包

sudo apt get安装libudunits2 dev

因为我是从源代码安装NetCDF的，所以我必须手动指定lib和include文件夹的位置

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我只是想澄清一下，因为您最初的问题是在R中，而修复程序是在R之外应用的。我最初试图这样做

install.packages（“libnetcdf-dev”），它不起作用

相反，从R:sudo外部获取安装libnetcdf dev

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在Ubuntu 20.04 LTS中，可以使用bash命令sudo apt install r-cran-ncdf4安装ncdf4包（包括所有依赖项）。同样，对于RNetCDF，您可以使用

sudo apt安装r-cran-RNetCDF

您需要安装这些包的

-dev

，以获取编译包所需的头。@Justin谢谢。

ncdf

所需的唯一附加软件包是

libnetcdf dev

用于

RNetCDF

，

udunits bin

和

libudunits2 dev

，以便安装ncdf4软件包（ncdf软件包的更新），我还需要运行

sudo-apt-get-install-netcdf-bin

？这个答案已经有7年了，它仍然需要某种烫发修复。

install.packages("/home/user/Downloads/RNetCDF_1.6.1-2.tar.gz", 
repos = NULL,
type="source",
dependencies=FALSE,
configure.args="--with-netcdf-include=/usr/local/netcdf-4.2.1-build/include --with-netcdf-lib=/usr/local/netcdf-4.2.1-build/lib")