R马尔可夫链包，是否可以设置节点的坐标和大小？

我正在研究R的一些生物学行为问题，我有一个转换矩阵，我想用某种方式绘制它

我正在使用

markovchain

包，这使得可视化变得容易

这是一个测试代码及其输出

> a<-array(0.25,dim = c(4,4))
> markov<-new("markovchain",transitionMatrix=a,states=c("a","b","c","d"), name="test")
> markov
test 
 A  4 - dimensional discrete Markov Chain defined by the following states: 
 a, b, c, d 
 The transition matrix  (by rows)  is defined as follows: 
 a    b    c    d
 a 0.25 0.25 0.25 0.25
 b 0.25 0.25 0.25 0.25
 c 0.25 0.25 0.25 0.25
 d 0.25 0.25 0.25 0.25

 > plot(markov)

马尔可夫 试验 由以下状态定义的四维离散马尔可夫链： a、 b、c、d 转换矩阵（按行）定义如下： a、b、c、d a 0.25 0.25 0.25 0.25 b 0.25 0.25 0.25 0.25 c 0.25 0.25 0.25 0.25 d 0.25 0.25 0.25 0.25 >图（马尔可夫）

问题是，我想设置图形节点的坐标，将它们放置在2D网格或类似的东西中，并设置节点的大小。 我知道这个软件包可以与

S4

一起使用，但我对它不是很熟悉，也不知道是否有任何参数对我有用。 有什么帮助吗？

您可以这样做：

layout <- matrix(c(0,0,0,1,1,1,1,0), ncol = 2, byrow = TRUE)

     # [,1] [,2]
# [1,]    0    0
# [2,]    0    1
# [3,]    1    1
# [4,]    1    0

plot(markov, vertex.size = 25, layout = layout)

你可以这样做：

layout <- matrix(c(4,-2,7,2,8,8,8,-4), ncol = 2, byrow = TRUE)
     # [,1] [,2]
# [1,]    4   -2
# [2,]    7    2
# [3,]    8    8
# [4,]    8   -4

plot(markov, vertex.size = 25, layout = layout)