IGRAPHE在尝试为边着色时简化了操作

我有几种细胞类型，想展示它们之间的联系。我的问题是，如果我只使用

plot（all.cnx）

，它会显示所有连接。但是，如果我想添加edge.color等，那么它可以简化图形。例如，“CT#1#U 3”与其他单元类型的连接。如何防止这种简化，因为我想显示所有边

谢谢， 伊利亚斯

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由于

edge.curved=0.5

，边缘重叠。它使所有的边都具有相同的曲率，因此，如果图形被简化，就会出现这种情况，但实际上边在那里，只是完美地重叠

要返回到您想要的，边中的曲线更少，您可以直接在

igraph

对象上使用函数

curve\u multiple（）

，并将结果向量传递到

edge.curve

plot(all.cnx, layout = my_layout,
     edge.color = my_edge_colors, edge.arrow.size=0.4,
     vertex.color = my_vertex_colors, vertex.size=30,vertex.frame.color="black",
     vertex.label.color="black",vertex.label.cex=0.5, vertex.label.dist=0,
     edge.curved = curve_multiple(all.cnx, .2)) # the default is 0.5

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这只会在需要曲线的地方弯曲边缘（即有重叠）。如果只删除

edge.curve

参数，它将重置为默认值，从而生成曲率更大但没有重叠的边。

所谓“简化”，是指连接节点CT#1#U 3和CT#2#U 7的边的合并吗？是的，这就是我的意思。它合并了两条边。我想展示这些边缘，因为它们是不同的颜色。非常感谢。完成！

plot(all.cnx, layout = my_layout,
     edge.color = my_edge_colors, edge.arrow.size=0.4,
     vertex.color = my_vertex_colors, vertex.size=30,vertex.frame.color="black",
     vertex.label.color="black",vertex.label.cex=0.5, vertex.label.dist=0,
     edge.curved = curve_multiple(all.cnx, .2)) # the default is 0.5