如何处理缺失值错误-vegan:：rda（）

我用

Vegan

R

软件包来分析我的数据。但是我的数据中缺少一些值，所以当我使用函数

rda

时。 输出如下：

#RDA
pca.rda <- rda(pcan ~ ., data = all.env, scale = FALSE)

首先，我将一些数据重新分类到因子中

---

all.env$Site您可以尝试用数据集中的中值替换缺少的（
NA
）数据：

all.env[is.na(all.env)] <- median(all.env, na.rm=TRUE)

all.env[is.na（all.env）]我不清楚您的数据是什么样子的，但是这个错误（x必须是数字）总是与数据框内的非数字值相关。PCA和RDA不处理因子，只处理数值变量

首先，导入数据时应注意这一点。如果从.txt文件导入数据，只需用NA填充缺少的值单元格，R将创建数值变量。如果您使用的是.xls（x）文件，则软件包需要对NA值进行不同的处理（请阅读帮助）

这可能会解决问题。但更多信息将使帮助更容易。
请提供一些示例数据，并解释您为获得此错误而采取的步骤。如果你的方法要求你的数据中没有缺失的值，那么你需要自己插补这些值：谢谢，请查看我的编辑。谢谢，我已经尝试过了。但是仍然得到错误信息“colMeans中的错误（x，na.rm=TRUE）：'x'必须是数字”
all.env$Site<-as.factor(all.env$Site)    
all.env$Type <- as.factor(all.env$Type)    
all.env$Slope<- as.factor(all.env$Slope)    
summary(all.env)

pcan <- rda(pcaall[7:72])    
pcan

pca.rda <- rda(pcan ~ .,data = all.env, scale=FALSE)

`all.env$SM[is.na(all.env$SM)] <- median(all.env$SM, na.rm=TRUE)`
`all.env$ST[is.na(all.env$ST)] <- median(all.env$ST, na.rm=TRUE)`

`pca.rda <- rda(pcan ~ .,data = all.env, scale=FALSE)`

all.env[is.na(all.env)] <- median(all.env, na.rm=TRUE)