在r中创建带彩色叶子的树状图图例

我已经在树状图中给叶子着色，如下所示

require(graphics)

dm <- hclust(dist(USArrests[1:5,]), "ave")

df<-data.frame("State"=c("Alabama","Alaska","Arizona","Arkansas","California"),   "Location"=c("South","North","West","South","West"))


color.sites<-function(dm){
    dend<-as.dendrogram(dm)
    plot(dend)

    cols <- attributes(dend)
    df$ColorGroups <- factor(df$Location)

    #Set colour pallette
    Location.Pal <- rainbow(nlevels(df$ColorGroups), s=0.9,v=0.9,start=0.1,end=0.9,alpha=1)

    colorleaves <- function (n) {
    # only apply to "leaves" in other words the labels
    if(is.leaf(n)) { 
        i <- which(df$State == attr(n,"label"))
        col.lab  <- Location.Pal[[unclass(df$ColorGroups[[i]])]]
        a <- attributes(n)
        attr(n, "nodePar") <- c(a$nodePar, list(lab.col = col.lab))
    }
    n
}

xx <- dendrapply(dend, colorleaves)

plot(xx, cex=3, cex.main=2, cex.lab=5, cex.axis=1, mar=c(3,3,3,3), main="Title")
}

color.sites(dm)

require（图形）
dm
使用
legend（）

将整个函数源复制到编辑器中并进行编辑以执行所需操作，然后将其分配给您自己的函数对象并使用它。如果由于找不到函数（它们可能未从名称空间中导出）而失败，请使用
ns:：
找出它是哪个名称空间的前缀，其中
ns
是相关的名称空间

尝试使用包中的一个选项来选择分类调色板

如果您已经知道如何使用和调整ggplot2图形，另一个解决方案是使用@Andrie

库（ggplot2）
图书馆（GGO）
dm请尝试将自己限制在每篇文章1个问题。多个问题都可以，只要将它们链接在一起以显示它们是相关的。在以后的文章中，请记住这一点。+1这可能是第一次，以便有人（我以外的人）使用
ggdendro
@Andrie发布解决方案：再次感谢
ggdendro
！！这是一个很好的包，可以管理树状结构，并使用流行的
ggplot2
@Dickoa绘制它们。感谢您让我了解ggdendro包。我需要像示例中一样显示高度，还需要树状图保持不变。排除coord_flip（）会导致树状图倒置。如何使用ggdendro，但方向与示例中相同，并且y轴上显示高度？再次感谢。
cols <- c("orange","forestgreen")
legend("topright", legend = c("North","South"),
       fill = cols, border = cols, bty = "n")

if (!is.null(et <- attr(x, "edgetext"))) {
    my <- mean(hgt, yTop)
    if (horiz) 
        text(my, x0, et)
    else text(x0, my, et)
}

library(ggplot2)
library(ggdendro)

dm <- hclust(dist(USArrests[1:5,]), "ave")

df <- data.frame(State = c("Alabama","Alaska","Arizona","Arkansas","California"),
                 Location = c("South","North","West","South","West"))


hcdata<- dendro_data(dm, type="rectangle")

hcdata$labels <- merge(x = hcdata$labels, y = df,  by.x = "label", by.y = "State")


ggplot() +
 geom_segment(data=segment(hcdata), aes(x=x, y=y, xend=xend, yend=yend)) +
 geom_text(data = label(hcdata), aes(x=x, y=y, label=label, colour = Location, hjust=0), size=3) +
 geom_point(data = label(hcdata), aes(x=x, y=y), size=3, shape = 21) +
 coord_flip() +
 scale_y_reverse(expand=c(0.2, 0)) +
 scale_colour_brewer(palette = "Dark2") + 
 theme_dendro()