R 列和行组中的多个方框图

因此，我试图通过从一组基因中绘制方框图来可视化我的数据，这样对于每个基因，我都有不同菌株的不同方框。数据大致如下所示：

Strain  gene1         gene2      gene3  .   .   .
 A    2.6336700     1.42802     0.935742
 A    2.0634700     2.31232     1.096320
 A    2.5798600     2.75138     0.714647
 B    2.6031200     1.31374     1.214920
 B    2.8319400     1.30260     1.191770
 B    1.9796000     1.74199     1.056490
 C    2.4030300     1.20324     1.069800
 C    1.4829864     5.570571    12.29139
 C    0.7212928     6.070519    11.63530
 .
 .
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所以对于这个例子，我想得到3张不同的图片（每个基因一张），每张图片应该包含3个盒子（每个菌株一张）。也许有一个简单的方法可以做到这一点，但到目前为止，我还是空白

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感谢您提供的所有答案/建议，这些都非常有用。

这里有一种使用

ggplot2

的方法

首先，我们将数据帧传递为长格式：

library(reshape2)
dfm <- melt(df)

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这里有一种使用

ggplot2

的方法

首先，我们将数据帧传递为长格式：

library(reshape2)
dfm <- melt(df)

该软件包非常适合这种分组。我总是发现它比

ggplot2

更容易使用。您也可以使用老式的base R“纸上墨水法”（ink on paper method）），尽管这是一种更为手动的方法

首先，您需要重塑数据帧（顺便说一句，这一步是通过朱巴建议的

restrape2

包完成的，但我将保留我的解决方案作为替代方案）

或者以另一种方式组合成一个面板

bwplot(paste(Strain, Gene) ~ Expression, tab)

该软件包非常适合这种分组。我总是发现它比

ggplot2

更容易使用。您也可以使用老式的base R“纸上墨水法”（ink on paper method）），尽管这是一种更为手动的方法

首先，您需要重塑数据帧（顺便说一句，这一步是通过朱巴建议的

restrape2

包完成的，但我将保留我的解决方案作为替代方案）

或者以另一种方式组合成一个面板

bwplot(paste(Strain, Gene) ~ Expression, tab)

看一看，看一看。来自同一本烹饪书：“要使用ggplot2制作图形，数据必须在数据框中，并且采用“长”（与宽相反）格式。）查看和。来自同一本烹饪书：“要使用ggplot2制作图形，数据必须采用数据框和“长”（与宽相反）格式。）

bwplot(paste(Strain, Gene) ~ Expression, tab)