R 插入符号包：所有函数不'；不适用于所有型号

我有下面的脚本，可以很好地与携程模型/派对包配合使用。当我将其与NNET模型/包交换时，varImp和plot（最终模型）抛出一个错误。我的“假设”是caret包中的helper函数可以与所有支持的模型一起工作

library(caret)
library(nnet)

#read in data
data = iris

#split data into training, test, and final test samples
trainIndex <- createDataPartition(data$Species, p=.80, list=F)
train = data[trainIndex,]
test = data[-trainIndex,]

#train and plot model fit
tree.fit = train(Species~., data=train, method="nnet")
varImp(tree.fit)
plot(tree.fit$finalModel)

#predict test data
tree.pred.test = predict(tree.fit, newdata=test)
confusionMatrix(tree.pred.test, test$Species)


> varImp(tree.fit)
nnet variable importance

  variables are sorted by maximum importance across the classes
Error in data.frame(`NA` = character(0), `NA` = character(0), `NA` = character(0),  : 
  row names supplied are of the wrong length
In addition: Warning message:
In format.data.frame(x, digits = digits, na.encode = FALSE) :
  corrupt data frame: columns will be truncated or padded with NAs
> plot(tree.fit$finalModel)
Error in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log) : 
  'x' is a list, but does not have components 'x' and 'y'

库（插入符号）
图书馆（nnet）
#读入数据
数据=虹膜
#将数据拆分为培训、测试和最终测试样本
trainIndex varImp（树型拟合）
nnet变量重要性
变量按类的最大重要性排序
数据帧中出现错误（`NA`=字符（0），`NA`=字符（0），`NA`=字符（0），：
提供的行名称长度错误
此外：警告信息：
格式为.data.frame（x，digits=digits，na.encode=FALSE）：
损坏的数据帧：列将被截断或用NAs填充
>绘图（tree.fit$finalModel）
xy.coords（x，y，xlabel，ylabel，log）中出错：
“x”是一个列表，但没有组件“x”和“y”

您正在“尝试”绘制

树。fit$finalModel

，它与

插入符号无关，因为它是原始模型类。如果不存在，则是一个问题

因为变量重要性问题似乎是
print.varImp.train
的一个bug。如果您将其分配给一个对象，并查看
重要性部分，您可以看到它。
今天使用
插入符号：：train（method=“nnet”）
遇到类似问题。
插入符号：：varImp（）
的输出很好，但是（从我所知）由于它还包含一列表示
总体
，因此我无法通过
caret:：plot（varImp（））
进行绘图。但是，我可以通过以下方式绘制变量重要性：

nn.m1.vi = varImp(nn.m1)
nn.m1.vi$importance = as.data.frame(nn.m1.vi$importance)[, -1]
plot(nn.m1.vi, main = "Var Imp: nn.m1")

从
sessionInfo（）
：

迈克尔你的第一点说得很有道理。再说一次，我的假设是火车函数是创建fit.finalModel的工具，因此将与它支持的任何模型兼容。在第二部分中，我找不到名称中包含varImp的任何元素。我在R studio中扩展了右侧的环境，并使用了attributes函数-没有看到它。再次感谢
R version 3.3.1 (2016-06-21)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
caret_6.0-71