R 带有数据子集向量的联合图

我正在使用R软件包vegan从社区数据生成NMDS排序图，并希望包括长度与所选物种重要性相对应的向量（即来自原点的箭头）。我如何才能将显示的箭头仅限于那些物种，比如说，在数据的前四分位？我可以计算每个向量的长度，但不知道如何将打印的箭头限制为符合所需标准的箭头。比如说,

require(vegan)

数据（沙丘）

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mdsImportantSpecies

行标识哪些点位于前四分位。然后，您可以使用它（如图所示）仅绘制这些点

ImportantSpecies = which(hyp > quantile(hyp, 0.75)

plot(mds$points[ImportantSpecies,1], mds$point[ImportantSpecies,2]) 
arrows(0, 0, mds$species[ImportantSpecies,1], 
             mds$species[ImportantSpecies,2], col = "grey50")

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（1） 在排序图中应始终使用

asp=1

。如果您使用纯素函数并发出

plot（mds，dis=“site”）

，则会自动执行此操作，但如果您想使用自己更麻烦的代码，请添加

asp=1

。（2） 使用

hyp谢谢你，Jari。我真的很感谢你提供的信息，我要求并自愿提供这些信息。至于物种得分的箭头——你是对的：充其量只是误导。我试图让一位比我更不了解情况的同事满意。很高兴你让我想起来了。