SLURM sacct显示'；批次'；和'；外部'；工作名称

我已将作业提交到SLURM队列，作业已运行并完成。然后，我使用

sacct

命令检查已完成的作业。但是查看sacct命令的结果，我注意到了我没有预料到的其他结果：

       JobID                        JobName      State      NCPUS  Timelimit
5297048                                test  COMPLETED          1   00:10:00  
5297048.bat+                          batch  COMPLETED          1           
5297048.ext+                         extern  COMPLETED          1       

谁能解释一下“批处理”和“外部”作业是什么，它们的目的是什么。为什么外部作业总是在主作业失败时完成

我试图搜索文档，但没有找到令人满意的完整答案

编辑：以下是我提交的脚本，用于生成上述

sacct

输出：

#!/bin/bash
echo test_script > done.txt

使用以下

sbatch

命令：

sbatch -A BRIDGE-CORE-SL2-CPU --nodes=1 --ntasks=1 -p skylake --cpus-per-task 1 -J jobname -t 00:10:00 --output=./output.out --error=./error.err < test.sh

sbatch-A-BRIDGE-CORE-SL2-CPU--nodes=1--ntasks=1--p skylake--CPU per task 1--J jobname--t 00:10:00--output=./output.out--error=./error.err

作业由多个作业步骤组成。每个作业步骤都单独显示。在输出中有$JOBID，它代表总体保留，$JOBID.batch，它代表您提交的主脚本

关于

外部

。。。我不确定，但我猜您开始了一个工作步骤，并将其命名为“外部”。在这种情况下，这就是该作业步骤的信息

---

如果您向我们展示您提交的脚本，我们可以澄清一些来源。

Slurm作业包含多个作业步骤，这些步骤都由Slurm单独说明（在资源使用方面）。通常，这些步骤是使用srun/mpirun创建的，并从0开始枚举。但除此之外，有时还有两个特殊步骤。例如，以以下作业为例：

sbatch-n4--wrap=“srun hostname；srun echo Hello World”

这导致以下sacct输出：

       JobID    JobName  Partition    Account  AllocCPUS      State ExitCode 
------------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------- 
5163571            wrap     medium      admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.bat+      batch                 admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.ext+     extern                 admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.0      hostname                 admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.1          echo                 admin          4  COMPLETED      0:0 

两个

srun

调用创建了步骤

5163571.0

和

5163571.1

。

5163571.bat+

说明批处理脚本所需的资源（在本例中，它只是

srun hostname；srun echo Hello World

--wrap将其放入文件并添加

#！/bin/sh

）

许多非MPI程序在批处理步骤中进行大量计算，因此在批处理步骤中考虑了ressource的使用情况

现在来看

5163571.ext+

：这一步说明了slurm之外该作业使用的所有资源。仅当使用了

包含

时，才会显示此选项

---

ssh会话是属于slurm作业但不直接由slurm控制的进程的一个示例。如果您使用ssh连接到运行某个作业的节点，那么您的会话将被放置到作业的上下文中（如果设置了cgroups，您将被限制到可用资源）。您在ssh会话中进行的所有计算都将在.extern作业步骤中进行说明。

如果$JOBID.batch代表我提交的脚本，外部问题还有待解决$JOBID代表什么？$JOBID代表总体保留。如果使用

-l

参数运行

sacct

，您将看到每一行给出的信息是不同的。也许您保留了8个CPU和两个作业步骤，每个步骤使用4个CPU。这将显示在

sacct

中。不幸的是，我看不到您的工作中正在启动任何jop步骤，也看不到任何对“外部”的引用。我对此一无所知。我认为

.ext

作业对于SLURM来说很常见，例如，您可以在这个不相关的问题中看到

sacct

输出显示了

.ext

作业步骤。谢谢你富有洞察力的回答，马库斯！