String 如何使用Julia替换字符串中的几个字符

我基本上是想解决这个问题：

我想用他们的赞美词T，G，C，A替换所有出现的A，C，G，T。。换句话说，所有A将替换为T，所有C将替换为G等

我以前曾使用

replace（）

函数将所有出现的“T”替换为“U”，并希望replace函数将一个字符列表替换为另一个字符列表，但我无法使其工作，因此它可能没有该功能

我知道我可以使用BioJulia软件包轻松解决这一问题，并已使用以下方法解决了这一问题：

# creating complementary strand of DNA
# reverse the string
# find the complementary nucleotide
using Bio.Seq
s = dna"AAAACCCGGT"

t = reverse(complement(s))

println("$t")

但我不想依赖这个包裹

这是我目前掌握的代码，如果有人能引导我朝着正确的方向走，那就太好了

# creating complementary strand of DNA
# reverse the string
# find the complementary nucleotide

s = open("nt.txt") # open file containing sequence

t = reverse(s) # reverse the sequence

final = replace(t, r'[ACGT]', '[TGCA]') # this is probably incorrect
# replace characters ACGT with TGCA

println("$final")

---

似乎

replace

还没有像Bash中的

tr

那样进行翻译。因此，这里有两种方法使用字典映射（BioJulia包似乎也使用字典）：

然后，如果

str=“AAAACCCGGT”

，您可以像这样使用

join

：

julia> join([compliments[c] for c in str])
"TTTTGGGCCA"

另一种方法是使用函数和

map

：

function translate(c)
    compliments[c]
end

然后：

字符串在Julia中是可编辑的对象；每种方法都会依次读取一个字符，

c

，然后将其传递给字典以获取补充字符。将从这些互补字符生成一个新字符串

---

Julia的字符串也是不可变的：您不能在原地交换字符，而是需要构建一个新字符串。

当我提供str=“AAACCCGGT”时，这非常有效，但如果我尝试打开一个文件并以这种方式获取字符串，则会出现“在dict的getindex中找不到”错误。另外，你能详细说明一下底部的函数是如何解决我的问题的吗？索引词典如何改变我的字符串？我目前正在阅读《掌握茱莉亚》，但我在《掌握茱莉亚》中只读了几章，昨天刚学了茱莉亚，所以虽然我理解了一点，但我仍然对其中的一些机制很不熟悉。要纠正错误，你可能正在阅读文件中的新行。字典没有映射这些内容，因此会出现错误。您可以尝试

map（translate，readchomp（s））

map（translate，str）

将基于str返回一个新的翻译字符串，类似地

replace（str，match，replacement）

也将返回一个新字符串，即：

x=“test”；y=替换（x，'e，'e'）；x、 y

返回

（“测试”、“测试”）

。他们不会更新您的原始字符串@Ismaelvengascastelló：我认为没有（方便的）方法来修改Julia的字符串，因为它们是不可变的，这对吗？我自己也在了解朱莉娅，很想知道我是否错过了什么。@ajcr我不这么认为，你可能想看看，并找到一个惯用的方法来做到这一点D

function translate(c)
    compliments[c]
end

julia> map(translate, str)
"TTTTGGGCCA"